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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006112`

染色体: Chr01 坐标: 76657694-76660224 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006112`
名称	SmilChr01G006112
描述	receptor kinase-like protein Xa21
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76657694 - 76660224 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006334`
GeneID	`131006334`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006334`
原始查询	`SmilChr01G006112`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor kinase-like protein Xa21
产物	receptor kinase-like protein Xa21
Arabidopsis	`AT3G56370` (AT3G56370) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824804] identity=38.5; qcov=0.813; evalue=2.05e-31; confidence=medium
Rice	`Os02g0111800` (OsCLVATA) - identity=38.2; qcov=0.771; evalue=2.74e-31; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006334

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057789528.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057789528.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057789528.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057789528.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789528.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76658330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B56
`Chr1:76659057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B125,B140,B32,B66,B73,B78,C16,C43,C50,C59,D4
`Chr1:76659122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B17,B90,B92
`Chr1:76659199`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A9,B12,B60,B73,B78,B85,B9,C16,C21,C29,C53,C55,C68,C83
`Chr1:76659205`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A9,B12,B60,B73,B78,B85,B9,C16,C21,C29,C53,C55,C68,C83
`Chr1:76659966`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A18,A23,A7,B13,B134,B34,B38,B79,C19,C79,C8,D3
`Chr1:76659988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr1:76660034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B25,C80
`Chr1:76660048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B40,B84,B90,C52
`Chr1:76660088`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B64,B7,B74,B89,C3,C60,C74,C78
`Chr1:76660122`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C80
`Chr1:76660122`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789528.1

214 aa

107

214

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 14-35 aa PF00560 LRR_1 39-59 aa PF00560 LRR_1 66-87 aa PF13516 LRR_6 87-102 aa PF00560 LRR_1 89-110 aa PF00560 LRR_1 113-135 aa PF00560 LRR_1 138-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789528.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	14	35	1e-19	67.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789528.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	39	59	1e-19	67.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789528.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	66	87	1e-19	67.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789528.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	87	102	2.8e-05	24.5	Leucine Rich repeat
`XP_057789528.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	89	110	1e-19	67.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789528.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	113	135	1e-19	67.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789528.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	138	158	1e-19	67.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933545.1
AACTCTAGGCTCACAAGAAGTGTTTTAGATTTGAATATAAATGGCATTTGTAGGCTTCTCGTTTTCTCACACAATTAGCACTCACAATATGGATGCATTTTCCCCATTTTCCCTTCTTTCGCTTCTCTTATTGTTTTCATGTCTTAGCCTCTCTGCTGCACACAACATAACTCAAATCAAAAGTGATGAATTCATACTTGTTGCCTTAAAATCCCACATCACTTCGGATCCTTACAATATTTTGAAAAATAACTGGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006334
ATGGAAGGAGATATACCGTCAAGTTTGTACCAATGTCCACAACTCGAGAGTATTGACTTGTCAGGCAACAACTTTGGTGGATATGTGCCTGCACAAATTTGGAATATCACACTGCTTAAGGAATTAGACCTTGGTGTGAACAATTTGAGAGGCCGCCTACCAAAAGACATTTGCTCGCATAACAACCTTCAAAGACTCAAACTACTTAGCCTGTGGTGGAACGAATTGGAGGGAGATATACCATTGAGTTTGGGTCAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789528.1
MEGDIPSSLYQCPQLESIDLSGNNFGGYVPAQIWNITLLKELDLGVNNLRGRLPKDICSHNNLQRLKLLSLWWNELEGDIPLSLGQCTQLESIDLSYNNFGGNVPREIGNITQLKELSLNRNNLKGDIPKEIGYLNYLEVLSMSNNKFSGRLPRQLWNVTTLRELRIGNISLIGMSLLFLLIFFIEALTTFIVISNKPIVNHIYRHFSVLFSVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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