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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006130`

染色体: Chr01 坐标: 76822114-76825762 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006130`
名称	SmilChr01G006130
描述	DNA excision repair protein ERCC-1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76822114 - 76825762 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014044`
GeneID	`131014044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014044`
原始查询	`SmilChr01G006130`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA excision repair protein ERCC-1-like
产物	DNA excision repair protein ERCC-1-like
Arabidopsis	`AT3G05210` (ERCC1) nucleotide repair protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819685] identity=70.1; qcov=0.79; evalue=1.02e-113; confidence=high
Rice	`Os10g0518900` (ERCC1) - identity=61.9; qcov=0.79; evalue=2.44e-91; confidence=high
GO	GO:0000110 (nucleotide-excision repair factor 1 complex); GO:0000710 (meiotic mismatch repair); GO:0003684 (damaged DNA binding); GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006289 (nucleotide-excision repair); GO:0006312 (mitotic recombination); GO:0070522 (ERCC4-ERCC1 complex); GO:0070914 (UV-damage excision repair)
KEGG	smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03834 (Rad10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797955.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057797955.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057797955.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797955.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797955.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76822777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B94,B98,C37
`Chr1:76822819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B71
`Chr1:76822822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C80
`Chr1:76822830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr1:76822879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,A23,B1
`Chr1:76823133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C69
`Chr1:76825388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B85
`Chr1:76825388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:76825446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797955.1

309 aa

154

309

Rad10

PF03834 Rad10 103-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797955.1`	Pfam	`PF03834`	Rad10	Domain	103	223	3.3e-50	169.6	Binding domain of DNA repair protein Ercc1 (rad10/Swi10)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941972.1
CTTTTTTCAAGTTGATGGTAAATTATATATCGACTTTGACTAATTACTCTCTCCAAACCACAAGAAACAATGCAAATATATCTTCAAACAATTTTTTCAGTATGTGAAACTCTGTAGAAATGACTTTTTTAATACTTCATAAATTAAGACGATGTCGTTTTGATCCAAGATAAGTTGGAAGAGTTTTACAGTTAATATTTAATATTGTTTCTCCCAATTCTCTCCTTGGCCGCGTTTCTCCGCCGCCGTCTGGAGCATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014044
ATGGAAAACAGAGGTGATCCTGAGCAGCAGAAACAGAATAATGCATCATTTGTTGTGAAAATACCTTCATATGAAGAGGTGGTTGAGAGCTCCCAACCTAAGTCGCAATCTTTATTCAAGCCTTCCTCCTCCTTTTCGCAAGCTTTCAATTTTATCAAAAACACTGAATTTTACACCACCCCGCCATCTGCACCGCTGGCTCAGTCCTCCAAAGATGCCCCTTCATCCTCTCAAGGATCTTATCCAAGGCAAACCATTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797955.1
MENRGDPEQQKQNNASFVVKIPSYEEVVESSQPKSQSLFKPSSSFSQAFNFIKNTEFYTTPPSAPLAQSSKDAPSSSQGSYPRQTIQSEAPSTSVSSAGANRNAIIVSHRQKGNPLLKHIRNVRWVFADVVCDYLLGQNACALYLSLRYHLLHPDYLYFRIRELQKNFKLRVVLCHVDVEDVVKPLLEVTKTALLHDCTLLCAWSLEECGRYLETIKVYENKPADLIQGQMDMDYISRLNHALTSIRQRLPSTPAPGEAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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