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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006133`

染色体: Chr01 坐标: 76850048-76850895 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006133`
名称	SmilChr01G006133
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76850048 - 76850895 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014052`
GeneID	`131014052`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014052`
原始查询	`SmilChr01G006133`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR
产物	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR
Arabidopsis	`AT5G20480` (EFR) EF-TU receptor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832170] identity=39.1; qcov=0.848; evalue=2.71e-30; confidence=medium
Rice	`Os06g0186100` - identity=44.2; qcov=0.73; evalue=3.3e-31; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014052

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797965.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797965.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797965.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797965.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797965.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76850092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B60,B72,C14,C45
`Chr1:76850097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C75,C80
`Chr1:76850132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B19,C2,C36,C79
`Chr1:76850135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C5,C84
`Chr1:76850140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B65,C64,C66,D10
`Chr1:76850142`	`GCA`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A1,B117
`Chr1:76850147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B19,C2,C36,C79
`Chr1:76850191`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A11
`Chr1:76850191`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A11
`Chr1:76850242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:76850254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr1:76850293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B21,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797965.1

211 aa

106

211

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_4

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 29-69 aa PF00560 LRR_1 75-96 aa PF00560 LRR_1 98-119 aa PF13855 LRR_8 121-159 aa PF12799 LRR_4 124-158 aa PF00560 LRR_1 126-147 aa PF00560 LRR_1 149-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797965.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	29	69	8.5e-11	42.7	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057797965.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	75	96	4.4e-15	53.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057797965.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	98	119	4.4e-15	53.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057797965.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	121	159	5.2e-12	46.1	Leucine rich repeat
`XP_057797965.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	124	158	2.8e-11	44.0	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057797965.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	126	147	4.4e-15	53.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057797965.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	149	170	4.4e-15	53.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941982.1
CTTGTTTTCTCACACAATTAGCACTCACAATATGGATACATTTCCCACCCTTCTTTTGCTTCTCATATTGTTTTCTTGTGTTAGCCTCTCTGCTGCACACAACATAACTCAAATCAAAAGTGATGAATATATACTTCTTGCCTTCAAATCCCACATCACTTTGGATCCTTCCAATATTTTGAAAAATAATTGGACCAGTGGAACCTCATTTTGCACATGGATAGGAGTTACTTGTGATTCGCGTCGTAGCAGGGTCACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014052
ATGGATACATTTCCCACCCTTCTTTTGCTTCTCATATTGTTTTCTTGTGTTAGCCTCTCTGCTGCACACAACATAACTCAAATCAAAAGTGATGAATATATACTTCTTGCCTTCAAATCCCACATCACTTTGGATCCTTCCAATATTTTGAAAAATAATTGGACCAGTGGAACCTCATTTTGCACATGGATAGGAGTTACTTGTGATTCGCGTCGTAGCAGGGTCACTAAATTAAATATCTCTGATATGGGACTCGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797965.1
MDTFPTLLLLLILFSCVSLSAAHNITQIKSDEYILLAFKSHITLDPSNILKNNWTSGTSFCTWIGVTCDSRRSRVTKLNISDMGLEGSIPQEIGNLSSLAYLDMSGNSFHGRLPKDICSHNNLQRLKLLDLSSNKLQGDIPSSLYQCPQLESIDLSRNSFGGYVPAQISNITLLKELDLGVNNLRDFGVNGKATALASNDILQFLSNMMNT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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