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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006138`

染色体: Chr01 坐标: 76890799-76892272 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006138`
名称	SmilChr01G006138
描述	receptor like protein 22-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76890799 - 76892272 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014065`
GeneID	`131014065`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014065`
原始查询	`SmilChr01G006138`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor like protein 22-like
产物	receptor like protein 22-like
Arabidopsis	`AT2G32660` (RLP22) receptor like protein 22 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817826] identity=43.1; qcov=1.01; evalue=6.45e-59; confidence=medium
Rice	`Os12g0221700` - identity=42.5; qcov=1.01; evalue=8.66e-60; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014065

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797972.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797972.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797972.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797972.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797972.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76890898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr1:76890993`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B32,B66,B78,C12,C29,C43,C59
`Chr1:76890996`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B32,B66,B78,C12,C29,C43,C59
`Chr1:76890998`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B32,B66,B78,C12,C29,C43,C59
`Chr1:76891007`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A21,B131,C36,C75,C82
`Chr1:76891007`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A21,B131,C36,C75,C82
`Chr1:76891054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:76891075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C65,C9
`Chr1:76891081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:76891084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:76891113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B17
`Chr1:76891180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797972.1

266 aa

133

266

LRR_1

LRR_6

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 98-118 aa PF13516 LRR_6 119-131 aa PF00560 LRR_1 120-141 aa PF13516 LRR_6 145-157 aa PF00560 LRR_1 145-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797972.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	98	118	3.3e-20	68.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057797972.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	119	131	2.8e-07	30.8	Leucine Rich repeat
`XP_057797972.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	120	141	3.3e-20	68.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057797972.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	145	157	2.8e-07	30.8	Leucine Rich repeat
`XP_057797972.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	145	166	3.3e-20	68.5	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941989.1
ATGGAAGGTCTTCCTGAGCTTCGAGTGCTCGTCTTGAAGTCTAATAAGTTTGATGGTAACATGTCGCTGCCTTCACGAAGCAACCTTCCATTTCCTAAGCTGCAAGTTTTAGATATATCAGAGAACGAATTTGTGGGCTCTCTACCTCAAAGATATTTCAAGAGTTTTAGAGCAATGATGGATGTAAAGGAAAATCAAATGTATAGAGATTATGGCTTTGAAAGATTTTTGGAGATGAGAATCACTTTGAAAGGTCTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014065
ATGGAAGGTCTTCCTGAGCTTCGAGTGCTCGTCTTGAAGTCTAATAAGTTTGATGGTAACATGTCGCTGCCTTCACGAAGCAACCTTCCATTTCCTAAGCTGCAAGTTTTAGATATATCAGAGAACGAATTTGTGGGCTCTCTACCTCAAAGATATTTCAAGAGTTTTAGAGCAATGATGGATGTAAAGGAAAATCAAATGTATAGAGATTATGGCTTTGAAAGATTTTTGGAGATGAGAATCACTTTGAAAGGTCTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797972.1
MEGLPELRVLVLKSNKFDGNMSLPSRSNLPFPKLQVLDISENEFVGSLPQRYFKSFRAMMDVKENQMYRDYGFERFLEMRITLKGLDQLLTRLLEAFTTIDLSSNNFSGSIPDSIGNLNSLRYLNLSHNNLMGHIPASLGNISVLESLDLSSNKLDGRIPSELTRLTFLAKLNLSMNDLVGQIPQSTQFSTFENDSYVGNLRLCGFPLTRKCNEENGQRMQPEEQDDEDDEYGFIDGFGWRSVVMGYGSGIIVGIGIGGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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