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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006143`

染色体: Chr01 坐标: 76923983-76924875 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006143`
名称	SmilChr01G006143
描述	receptor like protein 22-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76923983 - 76924875 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014081`
GeneID	`131014081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014081`
原始查询	`SmilChr01G006143`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor like protein 22-like
产物	receptor like protein 22-like
Arabidopsis	`AT2G33060` (RLP27) receptor like protein 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817868] identity=36.2; qcov=1.15; evalue=8.63e-42; confidence=medium
Rice	`Os01g0163000` - identity=33.6; qcov=1; evalue=1.84e-39; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797993.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797993.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797993.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797993.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76923992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B41,B90
`Chr1:76924061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:76924064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:76924105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B68,C53
`Chr1:76924105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C53
`Chr1:76924170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B64,B96,C57,C84
`Chr1:76924241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr1:76924247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:76924265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr1:76924271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C29,C83
`Chr1:76924375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr1:76924529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797993.1

268 aa

134

268

LRR_1

LRR_8

LRR_6

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 33-50 aa PF00560 LRR_1 101-121 aa PF13855 LRR_8 101-158 aa PF13516 LRR_6 122-134 aa PF00560 LRR_1 123-144 aa PF13516 LRR_6 148-160 aa PF00560 LRR_1 148-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797993.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	33	50	1.3e-17	60.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057797993.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	101	121	1.3e-17	60.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057797993.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	101	158	2.8e-12	46.9	Leucine rich repeat
`XP_057797993.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	122	134	5.9e-07	29.8	Leucine Rich repeat
`XP_057797993.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	123	144	1.3e-17	60.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057797993.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	148	160	5.9e-07	29.8	Leucine Rich repeat
`XP_057797993.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	148	169	1.3e-17	60.8	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942010.1
ATGGAAGCTCTTCCTAATCTTCAAGTACTTATATTGAAGTCCAACAAGTTTGATGGTAACATGTCGTTGGCTTCACGAAGCAACCTTCCATTTCAAAAGTTGCAAGTTTTAGATATATCTGACAATGAATTTGTGGGGTCTCTCCCTCAAACATATTTCAAGAACTTTAGAGCAATGATGGATGTGAAGGAAAATAAGACAGATCTAATTACAAGTATTGATTATTTTCTAAGGTATGTGGAGATGAGAATCACCTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014081
ATGGAAGCTCTTCCTAATCTTCAAGTACTTATATTGAAGTCCAACAAGTTTGATGGTAACATGTCGTTGGCTTCACGAAGCAACCTTCCATTTCAAAAGTTGCAAGTTTTAGATATATCTGACAATGAATTTGTGGGGTCTCTCCCTCAAACATATTTCAAGAACTTTAGAGCAATGATGGATGTGAAGGAAAATAAGACAGATCTAATTACAAGTATTGATTATTTTCTAAGGTATGTGGAGATGAGAATCACCTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797993.1
MEALPNLQVLILKSNKFDGNMSLASRSNLPFQKLQVLDISDNEFVGSLPQTYFKNFRAMMDVKENKTDLITSIDYFLRYVEMRITLKGLDQLLKRLLEDFTIIDLSSNKFSGTIPRFIGNLNSLRYLNLSHNNLMGHIPASLGNISVLESLDLSSNKLDGRIPSELTRLCGVPLTRKCNEENGQQMRPKEEDDKDDEYGFIDGFGWRSVVMGYGSGIIVGIGIGCWIIRFGRPRWLVEFFFGVGYTYKKKKKKKKKTRKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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