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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006151`

染色体: Chr01 坐标: 76964924-76970508 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006151`
名称	SmilChr01G006151
描述	receptor-like protein 9DC3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76964924 - 76970508 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006375`
GeneID	`131006375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006375`
原始查询	`SmilChr01G006151`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 9DC3
产物	receptor-like protein 9DC3
Arabidopsis	`AT2G33060` (RLP27) receptor like protein 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817868] identity=38.9; qcov=0.941; evalue=1.09e-91; confidence=medium
Rice	`Os12g0222800` - identity=41.6; qcov=0.918; evalue=4.42e-90; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789540.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789540.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789540.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789540.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789540.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76965026`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B125,C54
`Chr1:76965026`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B125,C54
`Chr1:76965061`	`TA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B78
`Chr1:76965115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr1:76965116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C65
`Chr1:76965116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:76965204`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C43,C60
`Chr1:76965204`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C43,C60
`Chr1:76965240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B119,B136,B96,D2
`Chr1:76965324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B2,B81
`Chr1:76965356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr1:76965357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789540.1

437 aa

218

437

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF13855 LRR_8 1-58 aa PF00560 LRR_1 2-21 aa PF00560 LRR_1 23-45 aa PF00560 LRR_1 47-69 aa PF13855 LRR_8 72-131 aa PF00560 LRR_1 96-118 aa PF00560 LRR_1 171-188 aa PF00560 LRR_1 241-261 aa PF13516 LRR_6 262-274 aa PF00560 LRR_1 263-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789540.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	1	58	1.6e-28	98.9	Leucine rich repeat
`XP_057789540.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	2	21	1.5e-32	105.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057789540.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	23	45	1.5e-32	105.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057789540.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	47	69	1.5e-32	105.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057789540.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	72	131	1.6e-28	98.9	Leucine rich repeat
`XP_057789540.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	96	118	1.5e-32	105.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057789540.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	171	188	1.5e-32	105.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057789540.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	241	261	1.5e-32	105.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057789540.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	262	274	5e-08	33.1	Leucine Rich repeat
`XP_057789540.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	263	284	1.5e-32	105.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933557.1
ACATATTGTGCAATTCAAAATCTAGAAAATAACATGGTCCAATACTATCCACCATTGGGAATCTATCAAATTTGATGGAGCTAGACCTTTCTTCCAACAAATTAAATGGTCCAATACCATCCACCATTTGGAATCTATCAAATTTGAAGTATTTAGTCCTCTCTTCCAACAAATTAAATGGTGAGCTTCCATTCTGCATCTGCAACTTGACATCCCTTCAGCTTCTTCTACTCTCAAATAACAGTTTGGAAGGGACAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006375
ATGGAGCTAGACCTTTCTTCCAACAAATTAAATGGTCCAATACCATCCACCATTTGGAATCTATCAAATTTGAAGTATTTAGTCCTCTCTTCCAACAAATTAAATGGTGAGCTTCCATTCTGCATCTGCAACTTGACATCCCTTCAGCTTCTTCTACTCTCAAATAACAGTTTGGAAGGGACAGTTCCACAATGCTTTCGAAACTTGAGCAAATCGTTGTCCATATTTCATTTAAATGCAAATAACTTTAGTGGCCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789540.1
MELDLSSNKLNGPIPSTIWNLSNLKYLVLSSNKLNGELPFCICNLTSLQLLLLSNNSLEGTVPQCFRNLSKSLSIFHLNANNFSGLIPSIFINGCSLQSINLSGNKLKGRLPKSLINCKSLKGLDVGNNRIRDKFPFWMEGLPKLRVLILKSNKFDGNMSLASRSNLPFQKLQVLDISDNEFVGSLPQTYFKNFRAMMDVKENKTDLITSSDDDSFLRYVEMRITLKGLDLLLTRLLKTFTTIDLSSNNFSGSIPDSIGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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