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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006162`

染色体: Chr01 坐标: 77038321-77039619 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006162`
名称	SmilChr01G006162
描述	putative receptor like protein 25
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	77038321 - 77039619 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014128`
GeneID	`131014128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014128`
原始查询	`SmilChr01G006162`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative receptor like protein 25
产物	putative receptor like protein 25
Arabidopsis	`AT2G25440` (RLP20) receptor like protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817082] identity=41.1; qcov=0.919; evalue=3.78e-61; confidence=medium
Rice	`Os12g0221700` - identity=43.2; qcov=0.866; evalue=3.82e-61; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798001.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798001.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798001.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798001.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:77038331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B15,B60,C53,D1
`Chr1:77038340`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B1,B124,B60,C53,D1
`Chr1:77038340`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B124,B60,C53,D1
`Chr1:77038357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:77038399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C63
`Chr1:77038402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr1:77038508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C74,D1
`Chr1:77038616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B123,B41,B52
`Chr1:77038639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B56,B96,C65,D6
`Chr1:77038692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr1:77038711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C19,C43
`Chr1:77038714`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798001.1

307 aa

154

307

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 33-50 aa PF00560 LRR_1 103-123 aa PF13516 LRR_6 124-136 aa PF00560 LRR_1 125-146 aa PF00560 LRR_1 150-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798001.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	33	50	3.3e-20	68.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057798001.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	103	123	3.3e-20	68.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057798001.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	124	136	4.5e-08	33.3	Leucine Rich repeat
`XP_057798001.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	125	146	3.3e-20	68.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057798001.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	150	171	3.3e-20	68.5	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942018.1
ATACCATTCACCATTGGGAATCTATCCAAGTTACGGTTGCTAGAGCTCTCTTCCAACAAATTAAATGGTGAGTTTCCATTCTCCATCTGCAACTTGACATCCCTTGGGATTCTTCTTCTCTCAAATAACAGTTTGGAAGGGACAGTTCCACAATGCTTTCGAAACTTGAGCAAATCGTTGTCCATATTTCATTTAAATGCAAATAACTTTAGTGGCCCCATTCCATCAATATTTATCAAAGGGTGTAGTCTTCGGTCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014128
ATGGAAGGTCTTCCTAAGCTTCGAGTACTCATATTGAAGTCCAACAAGTTTGATGGTAACATGTCGCTGCCTTCACGAAGCAACCTTCCATTTCAAAAGTTGCAAGTTTTAGATATATCTGACAATGAATTTGTGGGGTCTCTCCCTCAAACATATTTCAAGAACTTTAGAGCAATGATGGATGTGAAGGAAAATAAGACAGATCTAATTACAAGTAGTGATGATTTCGATTTTCTAAGGTATGTGGAGATGAGAATCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798001.1
MEGLPKLRVLILKSNKFDGNMSLPSRSNLPFQKLQVLDISDNEFVGSLPQTYFKNFRAMMDVKENKTDLITSSDDFDFLRYVEMRITLKGLDLLLKRLLKTFTTIDLSSNNFSGSIPDSIGNLNSLRYLNLSHNNLMGHIPASLGNISVLESLDLSSNKLDGGIPSELTRLTFLAKLNLSMNDLVGQIPQSTQFSTFDNDSYVGNMGLCGFPLTRKCNDENGHRMPPEEEDDEDDEYGFIDGFGWRSVVMGYGSGIIVGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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