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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006169`

染色体: Chr01 坐标: 77198652-77205021 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006169`
名称	SmilChr01G006169
描述	uncharacterized SmilChr01G006169
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	77198652 - 77205021 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006398`
GeneID	`131006398`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006398`
原始查询	`SmilChr01G006169`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0152500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0152500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0152500` - identity=24.6; qcov=0.234; evalue=8.45e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006398

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789546.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057789546.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789546.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789546.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789546.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:77202830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C24,C70
`Chr1:77202977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C32,C42
`Chr1:77202987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C68,C73
`Chr1:77203147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr1:77203179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B72,C30,C50,C64,C66
`Chr1:77203179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B72,C30,C50,C64,C66
`Chr1:77203305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr1:77203308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B10,B121
`Chr1:77203494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:77203502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789546.1

1010 aa

505

1010

DUF8566

PF29561 DUF8566 106-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789546.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	106	307	3.8e-49	168.0	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933563.1
AGAATAAGGAATTAATCCTTACCATAGGATCTGAATAAATTAATGGTCCAGATTAGCACTAATTACTAATTAATCTACATTATTTTTTTTACTGAATACCTTTAAAAATTATATATAAAATCGTTGGGGGTATGTTAGACATTTTGTCTATTCAGAAAACTGTCATTCCTAAATTAACTCCAGTAAATTAGGACATTTACTTTCACCCCCACTTTCATCCACCAAACCATCTTCCCCCCACTTTCGTCTGCCAAACCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006398
ATGACTAAAAAGGGAAAGAAGATAGCAGATGTTGGCGAGCCATCTTCAAGTAAAAGCAGAGTTAAACACAAGAAGACTAAAAGGGTAAAAGCAACTGAAGAAGGTGAAACCTCAAGCAAAACTGATACAAGGCTTAAGACAAAGACGAGACCTTTAAAAACAGCAAAAAGGATAATAACTACAGAGGAGCAGGCAGAGAGAATTAGGGTGCAAAGACGGAGGAATTTTAACAAGAACAAAGATGTTACCTGTAAACGTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789546.1
MTKKGKKIADVGEPSSSKSRVKHKKTKRVKATEEGETSSKTDTRLKTKTRPLKTAKRIITTEEQAERIRVQRRRNFNKNKDVTCKRRGDVKSELEGAPTKFPSLNTRTTPSSLFDELPKLNDAQRQAIQDIGFGSVLSLQVKKLPCRLAYWILEHFDENRCELELEGGIRVKITEDDVYRVYGFPKGSEIIPDFNRCSNTALCEEWVAFFGLANREKIKIGHVLSEMLDCTTGGTWFKRHFMIAMTHSLIQSCTSGTVYP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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