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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006172`

染色体: Chr01 坐标: 77239973-77247195 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006172`
名称	SmilChr01G006172
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	77239973 - 77247195 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006400`
GeneID	`131006400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006400`
原始查询	`SmilChr01G006172`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.1
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.1
Arabidopsis	`AT2G40460` (AT2G40460) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818640] identity=69.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0470700` (OsPTR3) - identity=50.4; qcov=0.979; evalue=1.94e-155; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0042937 (tripeptide transmembrane transporter activity); GO:0042938 (dipeptide transport); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0071916 (dipeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006400

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789548.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789548.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789548.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789548.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:77240328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:77242652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B27,B47,B55
`Chr1:77242872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B90,B92,C11,C69
`Chr1:77242912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:77246278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr1:77246382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C8
`Chr1:77246385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:77246472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C76,D3,D8
`Chr1:77246500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,C73,C81,D2
`Chr1:77246502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A22,B38,B78,C39
`Chr1:77246609`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B1,B114,C37
`Chr1:77246609`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B1,B114,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789548.1

578 aa

289

578

PTR2

PF00854 PTR2 95-512 aa

XP_057789549.1

470 aa

235

470

PTR2

PF00854 PTR2 1-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789548.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	95	512	1.9e-105	353.7	POT family
`XP_057789549.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	1	404	6e-99	332.3	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933565.1
TTTAAAATTATTTAAAGGCATCCATTCATGGACCCAATAAATTTAGACCCGACCCAATTCAATCGAACCCGATCCAGTAAATTCAACCAGTTGACTCGACCCAAGCAACTAGCATTTATCCTTTGCTATAATATATGATGAGCATTATCCCCTTAAAGAAGGGAGCAGCCGAGGAAGTGATTCACAGCGACAGCGGTAGCAGAATCTTGCATACCGCACCGCCTACTTATAACCCTCCACACTTTCCCACTCCCTTAATT...

XM_057933566.1
CATGTTGCTGAGGCACCTTATATCATATGTGATATCCACATAAATAAATCCATGGGTTGGTTGAGGTTGATGCGTCATTCATCTTTGATGGGAATGTGACTTACTTATTTCTTGGGATGGTCCTTCTAACAATGGCGGTGTCGATCAAGTTGTTGAAGCCTAGTTGCGAAAACGGAGTGTGCAGCAAGGCTACCACAACGCAGATCGCATTCTTCTACACATCCCTCTACATAATAGGCATAGGCGCCGGCGGCACAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006400
ATGGATTCCAAAGGCTACACACAAGACGGCACAGTCGATCTCCGCGGCCGCCCCGCCATCGCCGACAAGACCGGCAAATGGAAAGCTTGTGCTTTCCTCGTCGGTTACGAAGCGTTCGAACGAATGGCGTTCTATGGTATTGCTTCAAATTTGGTGGTATACTTGACAACTCAACTCCATGAAGACACGGTTTCATCAGTTAGAAACGTGAACAACTGGTCCGGAGCTGTTTGGATCACACCCATTCTTGGTGCATACAT...

LOC131006400
ATGGTCCTTCTAACAATGGCGGTGTCGATCAAGTTGTTGAAGCCTAGTTGCGAAAACGGAGTGTGCAGCAAGGCTACCACAACGCAGATCGCATTCTTCTACACATCCCTCTACATAATAGGCATAGGCGCCGGCGGCACAAAGCCTAACATCTCCACATTCGGCGCCGACCAATTCGACGATCTAAACCCCCATGAGAAGAAGCTCAAGGCCTCCTTCTTCAACTGGTGGATGTTCAGCGCCTTCACCGGCGCCTTGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789548.1
MDSKGYTQDGTVDLRGRPAIADKTGKWKACAFLVGYEAFERMAFYGIASNLVVYLTTQLHEDTVSSVRNVNNWSGAVWITPILGAYIADSYLGRFWTFTISSLIYVIGMVLLTMAVSIKLLKPSCENGVCSKATTTQIAFFYTSLYIIGIGAGGTKPNISTFGADQFDDLNPHEKKLKASFFNWWMFSAFTGALFATLGLVYIQENLGWGLGYGIPTVGLILSLIIFYIGTPLYRHKVRRTNKPAGDILRVVVTAVANAR...

XP_057789549.1
MVLLTMAVSIKLLKPSCENGVCSKATTTQIAFFYTSLYIIGIGAGGTKPNISTFGADQFDDLNPHEKKLKASFFNWWMFSAFTGALFATLGLVYIQENLGWGLGYGIPTVGLILSLIIFYIGTPLYRHKVRRTNKPAGDILRVVVTAVANARLERPAHPSELHELDQHYYITTRKRRVHHTPVFRFLDMAAIKSEKSRRQACSVTQVEEAKLVVGMCMIWAVTLIPSTIWAQINTLFVKQGTTLDRHLGPTFQIPAASLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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