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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006173`

染色体: Chr01 坐标: 77248254-77258433 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006173`
名称	SmilChr01G006173
描述	uncharacterized SmilChr01G006173
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	77248254 - 77258433 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006401`
GeneID	`131006401`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006401`
原始查询	`SmilChr01G006173`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TLC ATP/ADP transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830413]; symbol=AT5G05310; hit=AT5G05310; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TLC ATP/ADP transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830413]; symbol=AT5G05310; hit=AT5G05310; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G05310` (AT5G05310) TLC ATP/ADP transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830413] identity=63.9; qcov=0.984; evalue=2.74e-169; confidence=high
Rice	`Os12g0112300` - identity=61.7; qcov=0.964; evalue=3.2e-156; confidence=high
GO	GO:0005471 (ATP:ADP antiporter activity); GO:0006862 (nucleotide transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03219 (TLC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006401

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057789552.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057789553.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057789554.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057789552.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057789554.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:77248436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C29
`Chr1:77253650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B90,B92
`Chr1:77256319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:77257396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B103,B62
`Chr1:77257422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr1:77257457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B114,D11
`Chr1:77257509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,D10,D11
`Chr1:77257859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B2,D10
`Chr1:77257875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C29
`Chr1:77258066`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B140,C82
`Chr1:77258066`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr1:77258068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789552.1

512 aa

256

512

TLC

PF03219 TLC 400-494 aa

XP_057789553.1

478 aa

239

478

TLC

PF03219 TLC 366-460 aa

XP_057789554.1

385 aa

192

385

TLC

PF03219 TLC 273-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789552.1`	Pfam	`PF03219`	TLC	Family	400	494	1.6e-05	24.7	TLC ATP/ADP transporter
`XP_057789553.1`	Pfam	`PF03219`	TLC	Family	366	460	1.5e-05	24.8	TLC ATP/ADP transporter
`XP_057789554.1`	Pfam	`PF03219`	TLC	Family	273	367	1.1e-05	25.2	TLC ATP/ADP transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933569.1
GGTCCTAAAAGAAACGCCACTATGACACTGTGAGGCTTCCGCATTTGGACATGATTCTAATTTTCAATTTCCCCATCCATGATTTCCCTTTTTTCCCTTGAAAGATCGCGATATCATACATGGTCAGAATGGTAATCGATAAATCTCGTGTAGAATCAATTATTTCAATTTTCGTTACTGTTCATCCCCACGAAACCTCTGCATTGATCTCTTCGACCTCCACATTTTTCTTTGTATTGAGTGCGTACTTCGTGGTGCTT...

XM_057933570.1
TAAAAGAAACGCCACTATGACACTGTGAGGCTTCCGCATTTGGACATGATTCTAATTTTCAATTTCCCCATCCATGATTTCCCTTTTTTCCCTTGAAAGATCGCGATATCATACATGGTCAGAATGGTATTGAGTGCGTACTTCGTGGTGCTTCCGTTGCGGGATGAAGGTGCGATATCGTTGGGTTTGGGGAATCTTCCAAGTCTCTTCGTCGGATCACTGCTGCTCACGTTGGTTGCTGCGCCTGTTTCAACCCTCGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131006401
ATGGTCAGAATGGTAATCGATAAATCTCGTGTAGAATCAATTATTTCAATTTTCGTTACTGTTCATCCCCACGAAACCTCTGCATTGATCTCTTCGACCTCCACATTTTTCTTTGTATTGAGTGCGTACTTCGTGGTGCTTCCGTTGCGGGATGAAGGTGCGATATCGTTGGGTTTGGGGAATCTTCCAAGTCTCTTCGTCGGATCACTGCTGCTCACGTTGGTTGCTGCGCCTGTTTCAACCCTCGTCTTTTCGTTACC...

LOC131006401
ATGGTCAGAATGGTATTGAGTGCGTACTTCGTGGTGCTTCCGTTGCGGGATGAAGGTGCGATATCGTTGGGTTTGGGGAATCTTCCAAGTCTCTTCGTCGGATCACTGCTGCTCACGTTGGTTGCTGCGCCTGTTTCAACCCTCGTCTTTTCGTTACCGAATCTCTCCAAAGGAAAAGCTTTGTTCCTGATACACCGGTTTTTTAGCTTCTCTCTTGTTATATTCTTTGTTCTATGGCTTTTTTCTACACCTGGAAGTTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057789552.1
MVRMVIDKSRVESIISIFVTVHPHETSALISSTSTFFFVLSAYFVVLPLRDEGAISLGLGNLPSLFVGSLLLTLVAAPVSTLVFSLPNLSKGKALFLIHRFFSFSLVIFFVLWLFSTPGSSSFKAKEMLPVKTIVKDELKVTVDETITANSGGWESHGWFYILVRIAMFLWVALLNLITISSTWARVIDVMDNESGSRLFGFIGAGATLGQLFGSLFATGMAWVGPYLLLVSALLLEFAAQSSVGINKDVSQHPEELSPL...

XP_057789553.1
MVRMVLSAYFVVLPLRDEGAISLGLGNLPSLFVGSLLLTLVAAPVSTLVFSLPNLSKGKALFLIHRFFSFSLVIFFVLWLFSTPGSSSFKAKEMLPVKTIVKDELKVTVDETITANSGGWESHGWFYILVRIAMFLWVALLNLITISSTWARVIDVMDNESGSRLFGFIGAGATLGQLFGSLFATGMAWVGPYLLLVSALLLEFAAQSSVGINKDVSQHPEELSPLRKADNDDVSETDGKSEMALQASSPRISTSRGKPH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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