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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006178`

染色体: Chr01 坐标: 77314198-77316628 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006178`
名称	SmilChr01G006178
描述	CBL-interacting protein kinase 18-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	77314198 - 77316628 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006405`
GeneID	`131006405`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006405`
原始查询	`SmilChr01G006178`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CBL-interacting protein kinase 18-like
产物	CBL-interacting protein kinase 18-like
Arabidopsis	`AT5G58380` (SIP1) SOS3-interacting protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835951] identity=58.3; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0678600` (OsCIPK02) - identity=62.5; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF03822 (NAF); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF14531 (Kinase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006405

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789559.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789559.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057789559.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057789559.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789559.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:77314556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr1:77314561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:77314613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14
`Chr1:77314636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C51,C63,C65
`Chr1:77314646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:77314673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:77314757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:77314835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr1:77314853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:77314854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B77
`Chr1:77314973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:77315144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,C28,C39,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789559.1

440 aa

220

440

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Kinase-like

NAF

PF00069 Pkinase 16-270 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 18-266 aa PF14531 Kinase-like 107-258 aa PF03822 NAF 307-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789559.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	16	270	2.7e-77	260.4	Protein kinase domain
`XP_057789559.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	18	266	2.1e-39	136.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057789559.1`	Pfam	`PF14531`	Kinase-like	Family	107	258	8.2e-09	35.8	Kinase-like
`XP_057789559.1`	Pfam	`PF03822`	NAF	Domain	307	359	2.2e-19	70.0	NAF domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933576.1
ATTTATACCAACAACCGCAAAAATGTGCTCACCTCAACATTACTCTCTTCTCTCTCTTGTGGCTTTGGATCCAACCGAACCGAAGCCCTCTTTGCTTCAATCTTCATCAAGAGGTTCTCCTTATTCTTCGACGACATCCAAACTCCCTAGGGATGCTGAAAGATGTATATTGTTGTTGAGGCTTCCACGTGGGCTGTTTGCAACATTTCGCCCAACGCATACCAACTATGGTTTCCTAAGGACTACAACGATTATATTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006405
ATGGAGACGTCGACGAAGAAGAAGGAGAACATATTGATGAAGAAATATGAAGTAGGGAGGATGTTAGGTCAAGGCGCTTTTGCCAAAGTTTACTACGGTAGGAATGTGAGAACAGGGCAGAGTGTGGCAATCAAGGTTATCGACAAGCAAAAAGTGGTGAAAGTTGGGCTCATCAATCAGATCAAACGAGAGATCTCCATCATGAACCTGGTCAGGCACCCCAACATCATGCATCTTGAGGAAGTCATGGCCACCAAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789559.1
METSTKKKENILMKKYEVGRMLGQGAFAKVYYGRNVRTGQSVAIKVIDKQKVVKVGLINQIKREISIMNLVRHPNIMHLEEVMATKTKIYFIMEYAKGGELFKKIVKGRLKEEAARAYFQQLIRAVDFCHSRGVYHRDLKPENLLLDENGNLKVSDFGLSALSESKRQDGLLHTTCGTPAYVSPEVISKRGYDGAKSDIWSCGVILFVMLAGHLPFHCRNLMDMYRNIAKASYKCPHWFSPEVRRLLSRILDPNPNTRIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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