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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006184`

染色体: Chr01 坐标: 77356699-77357470 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006184`
名称	SmilChr01G006184
描述	protein G1-like6
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	77356699 - 77357470 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014183`
GeneID	`131014183`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014183`
原始查询	`SmilChr01G006184`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein G1-like6
产物	protein G1-like6
Arabidopsis	`AT1G07090` (LSH6) LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS-like protein (DUF640) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837220] identity=71; qcov=0.359; evalue=9.25e-32; confidence=low
Rice	`Os04g0516200` (OsG1L4) - identity=76.5; qcov=0.354; evalue=2.33e-31; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009299 (mRNA transcription); GO:0009416 (response to light stimulus)
KEGG	-
Pfam	PF04852 (ALOG_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014183

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798061.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798061.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798061.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798061.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:77356723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C1,C6
`Chr1:77356937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C37
`Chr1:77356945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B5,B78,C70
`Chr1:77356965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B130
`Chr1:77356978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C73
`Chr1:77357012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C50
`Chr1:77357033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr1:77357035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr1:77357038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B2,B56
`Chr1:77357044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B22,C22
`Chr1:77357045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	62	A16,A23,A4,B1,B100,B101,B105,B12,B122,B123,B124,B126,B132,B135,B138,B140,B15,B17,B20,B24,B28,B31,B34,B37,B38,B39,B48,B50,B53,B55,B57,B58,B67,B78,B80,B9,B99,C11,C38,C39,C43,C49,C5,C50,C58,C63,C65,C67,C69,C70,C75,C77,C78,C79,C80,C83,C84,C87,D11,D3,D5,D6
`Chr1:77357047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798061.1

192 aa

192

ALOG_dom

PF04852 ALOG_dom 41-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798061.1`	Pfam	`PF04852`	ALOG_dom	Domain	41	109	2.6e-28	99.4	ALOG domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942078.1
ATGGCATGTAAATTACTAAACTATGACCAAATTCTGTCTGGTCCAGCCCTAGTGAGCTACTGCAACTCGAGCAGCCCTACATCGGAGACGAGCTCCGTCAGCCAGAAGGCGGTGGCGGGTGCGCCACCTTCGTCCCTGAGCCGGTACGAGTCGCAGAAATGGCGCAACTGGAACACGTCCGGGCGGTATCTGAAGAACCACAAGCCACTGCTGGTGCTGAGCCATTGTAGCGGGGCCCACATCCTTGAATTCCTCCGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014183
ATGGCATGTAAATTACTAAACTATGACCAAATTCTGTCTGGTCCAGCCCTAGTGAGCTACTGCAACTCGAGCAGCCCTACATCGGAGACGAGCTCCGTCAGCCAGAAGGCGGTGGCGGGTGCGCCACCTTCGTCCCTGAGCCGGTACGAGTCGCAGAAATGGCGCAACTGGAACACGTCCGGGCGGTATCTGAAGAACCACAAGCCACTGCTGGTGCTGAGCCATTGTAGCGGGGCCCACATCCTTGAATTCCTCCGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798061.1
MACKLLNYDQILSGPALVSYCNSSSPTSETSSVSQKAVAGAPPSSLSRYESQKWRNWNTSGRYLKNHKPLLVLSHCSGAHILEFLRYLDQFGKTKVHTAGCPFFGHPHPLPPPPPRPAPAFSARPGEASMHSSASYAPPSRRTTAGRRPIPSAHAVSPMRRKRGRSPQSSRCRRQIRGQGLTALLSLLKESN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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