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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000010`

染色体: Chr02 坐标: 84040-85772 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000010`
名称	SmilChr02G000010
描述	putative UPF0481 protein At3g02645
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	84040 - 85772 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012449`
GeneID	`131012449`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012449`
原始查询	`SmilChr02G000010`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UPF0481 protein At3g02645
产物	putative UPF0481 protein At3g02645
Arabidopsis	`AT4G31980` (AT4G31980) PPPDE thiol peptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829328] identity=33.2; qcov=1.04; evalue=9.87e-49; confidence=low
Rice	`Os01g0562600` - identity=29.1; qcov=1.04; evalue=6.93e-38; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012449

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057796387.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057796387.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057796388.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796387.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796387.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:84372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,C20,C3,C86,D5
`Chr2:84377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,C20,C3,C86,D5
`Chr2:84479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B25
`Chr2:84650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B49,B69,B77,B91,C30
`Chr2:84667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C48
`Chr2:84788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B46,B49
`Chr2:84821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B46
`Chr2:85082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:85112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B63,B65,C37,C83
`Chr2:85177`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B69
`Chr2:85177`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr2:85200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796387.1

406 aa

203

406

DUF247

PF03140 DUF247 30-397 aa

XP_057796388.1

381 aa

190

381

DUF247

PF03140 DUF247 30-306 aa PF03140 DUF247 311-372 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796387.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	30	397	3.1e-105	353.5	Plant protein of unknown function
`XP_057796388.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	30	306	2.5e-89	301.2	Plant protein of unknown function
`XP_057796388.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	311	372	2.5e-89	301.2	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940405.1
ATGAAGTCTTTCTCTAAAGTAAAGTTCTTGGAAATTGACTTAATTTCTGTCACAAGATTCACTTTATGAATACAATAATTTCTGGTTAGTTGCACCAAACGCTCACTTTGTCAATACAATAATGCAAAGATGGGAAGAAAGCTCTTTAAAAAGAAAATAGCGCGAAGAAATCAGCTGCAGCAACCACGACAGCTTAAGGTGCACTAGTTTCTCTAACTTTTTTCGTCTGAGGAGCTCTGCTGCTAATCTACATATATATT...

XM_057940404.1
AAGTCTTTCTCTAAAGTAAAGTTCTTGGAAATTGACTTAATTTCTGTCACAAGATTCACTTTATGAATACAATAATTTCTGGTTAGTTGCACCAAACGCTCACTTTGTCAATACAATAATGCAAAGATGGGAAGAAAGCTCTTTAAAAAGAAAATAGCGCGAAGAAATCAGCTGCAGCAACCACGACAGCTTAAGGTGCACTAGTTTCTCTAACTTTTTTCGTCTGAGGAGCTCTGCTGCTAATCTACATATATATTTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012449
ATGACAGAGGAGAGAGATTGTGTTACTGTTAGGATTGAAAACTTGCTTGATCATTTGTCTACTTCATTCACTCCCTCAAAGCCTATCATAGCTAAAGTGGATCAACACCTAAGGCAAGTAAACGAAAAGGATTTTGAACCCGAAATAGTTTCTATAGGTCCAATTCATCGTGGGAAAGATCGCGTTAAGGGCATGGAGCAACACAAACTGAGGTATCTAAGAAAAGTAGTAGGAAGAAGAGATGAGTTGAGCATTGAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796387.1
MTEERDCVTVRIENLLDHLSTSFTPSKPIIAKVDQHLRQVNEKDFEPEIVSIGPIHRGKDRVKGMEQHKLRYLRKVVGRRDELSIEKCVLEVRSMEEKARLYYPKSISLDQDEFVEMLLLDGCFVIELLRSYWFSDLRDKNDQIFQFDHMLVQIRHDLLLLENQLPFFVLNELFDMTKMEDPDDNIHDLLLFLAGDVLPWPDSSKLDSSSDMLHNAEHLLGLVYDSCFSFSFSAKHFTENNGSNTVHHTYSASEMEEGGI...

XP_057796388.1
MTEERDCVTVRIENLLDHLSTSFTPSKPIIAKVDQHLRQVNEKDFEPEIVSIGPIHRGKDRVKGMEQHKLRYLRKVVGRRDELSIEKCVLEVRSMEEKARLYYPKSISLDQDEFVEMLLLDGCFVIELLRSYWFSDLRDKNDQIFQFDHMLVQIRHDLLLLENQLPFFVLNELFDMTKMEDPDDNIHDLLLFLAGDVLPWPDSSKLDSSSDMLHNAEHLLGLVYDSCFSFSFSAKHFTENNGSNTVHHTYSASEMEEGGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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