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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000012`

染色体: Chr02 坐标: 90576-95584 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000012`
名称	SmilChr02G000012
描述	actin-1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	90576 - 95584 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012451`
GeneID	`131012451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012451`
原始查询	`SmilChr02G000012`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-1-like
产物	actin-1-like
Arabidopsis	`AT5G09810` (ACT7) actin 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830841] identity=74.8; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0718100` (ACT1) - identity=74.2; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00022 (Actin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057796390.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057796390.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796390.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796390.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796390.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:92615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B27,B71,B98
`Chr2:92660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,B9,B95,C10
`Chr2:92741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B53,B71,C6,D3
`Chr2:93011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:93034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B131,C85
`Chr2:93042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:93094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B24,C24,C39,C60
`Chr2:93167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr2:93312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:93423`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr2:93423`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr2:93477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796390.1

353 aa

176

353

Actin

PF00022 Actin 2-42 aa PF00022 Actin 49-345 aa

XP_057796391.1

353 aa

176

353

Actin

PF00022 Actin 2-42 aa PF00022 Actin 49-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796390.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	2	42	2.6e-121	405.8	Actin
`XP_057796390.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	49	345	2.6e-121	405.8	Actin
`XP_057796391.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	2	42	2.6e-121	405.8	Actin
`XP_057796391.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	49	345	2.6e-121	405.8	Actin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940407.1
TGCTTACAGATTTGCATCATGTAGTGGGTTTGTTAGAGATGCATGGAAAATTCTTTGGAGAAAGGATAATTGTCTTGCAATTGCTAATATGGATTCAATAATATCTGAGATAGCATCACCTTCAATGATGCTGTAGGTGTGTGTTAAGTTCTCCTTGTCGATGCCTTCGACACGGTCTTTGACACTCTTATACTGACCCCCATCGCCAAAATGGATAACCTTAAAGGGTGGCAACGCCGCCATCCCCTTCCAAGATCTCG...

XM_057940408.1
CGAAATAGGCCAAGTCGGCTGGGAGTAGAAAATAGAATCTTAGTCTCTTGGGAAAATGGATATCCAGTCGTTGGTATGTGATAACGGAACTGGAATGGTGAAGGCCGGGTTTGCCGGGGAAGAAACTCCAAGAGCAGTTTTCCCCAGCATCGTTGGACGACCCCAACGCACCGGTGTGATGGGACAAATGGATGCATACAACTGGGATGATATGGAGAAGTTATGGCATCACACTTTCCACAATGTGCTTCGTGTTGCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012451
ATGGATATCCAGTCGTTGGTATGTGATAACGGAACTGGAATGGTGAAGGCCGGGTTTGCCGGGGAAGAAACTCCAAGAGCAGTTTTCCCCAGCATCGTTGGACGACCCCAACGCACCGGTGTGATGGGACAAATGGATGCATACAACTGGGATGATATGGAGAAGTTATGGCATCACACTTTCCACAATGTGCTTCGTGTTGCTCCGGAGAAGCATCCCATCCTTGTAACCGAGCAGCCTCTGACTCCCAAGGCCAATAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796390.1
MDIQSLVCDNGTGMVKAGFAGEETPRAVFPSIVGRPQRTGVMGQMDAYNWDDMEKLWHHTFHNVLRVAPEKHPILVTEQPLTPKANKEKMAQIMFEKFNVPAMHFAIQAVLALYATGRTTGVVLDSGDGMSHIVPIYEAYSLPHAILRLDLGGRDLTDYLMKMLTERGYMFTTSEEREAVRDVKEKLSYVALDYEKELETTKTTSNVEQNYKLPDGQTISVGAERFLCPEVLFQPSFIGMQAVGIHETTYDCIKKCDVDM...

XP_057796391.1
MDIQSLVCDNGTGMVKAGFAGEETPRAVFPSIVGRPQRTGVMGQMDAYNWDDMEKLWHHTFHNVLRVAPEKHPILVTEQPLTPKANKEKMAQIMFEKFNVPAMHFAIQAVLALYATGRTTGVVLDSGDGMSHIVPIYEAYSLPHAILRLDLGGRDLTDYLMKMLTERGYMFTTSEEREAVRDVKEKLSYVALDYEKELETTKTTSNVEQNYKLPDGQTISVGAERFLCPEVLFQPSFIGMQAVGIHETTYDCIKKCDVDM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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