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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000020`

染色体: Chr02 坐标: 161505-162377 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000020`
名称	SmilChr02G000020
描述	splicing factor 3B subunit 6-like protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	161505 - 162377 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012452`
GeneID	`131012452`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012452`
原始查询	`SmilChr02G000020`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	splicing factor 3B subunit 6-like protein
产物	splicing factor 3B subunit 6-like protein
Arabidopsis	`AT5G12190` (AT5G12190) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831092] identity=87.9; qcov=0.984; evalue=9.58e-77; confidence=high
Rice	`Os03g0811700` - identity=85.8; qcov=0.952; evalue=6e-74; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005686 (U2 snRNP); GO:0071011 (precatalytic spliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF13893 (RRM_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012452

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057796392.1`
2	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057796392.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057796392.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057796392.1`
5	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057796392.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:161682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,C22,C40,C44,C53
`Chr2:161708`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A2,A21,A23,A3,A7,B10,B100,B104,B107,B109,B117,B118,B127,B129,B13,B131,B133,B136,B16,B18,B20,B21,B24,B27,B28,B29,B30,B35,B36,B40,B45,B50,B53,B58,B59,B60,B63,B66,B67,B69,B70,B74,B8,B85,B92,B94,B99,C11,C13,C14,C22,C24,C27,C28,C30,C32,C34,C37,C38,C40,C44,C46,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C57,C62,C63,C68,C69,C72,C74,C77,C79,C83,C84,C87,C9,D1,D10,D5
`Chr2:161726`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	105	A11,A2,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A7,B10,B100,B102,B104,B107,B109,B115,B117,B118,B127,B129,B13,B131,B133,B136,B15,B16,B18,B20,B21,B23,B24,B27,B28,B35,B36,B40,B41,B45,B48,B50,B53,B59,B60,B63,B65,B66,B67,B69,B70,B74,B8,B82,B85,B90,B92,B94,B99,C10,C11,C13,C14,C18,C2,C22,C24,C27,C28,C30,C32,C34,C37,C38,C40,C42,C43,C44,C46,C48,C49,C51,C52,C53,C57,C6,C60,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C71,C72,C74,C77,C79,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D5,D9
`Chr2:161729`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	105	A11,A2,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A7,B10,B100,B102,B104,B107,B109,B115,B117,B118,B127,B129,B13,B131,B133,B136,B15,B16,B18,B20,B21,B23,B24,B27,B28,B35,B36,B40,B41,B45,B48,B50,B53,B59,B60,B63,B65,B66,B67,B69,B70,B74,B8,B82,B85,B90,B92,B94,B99,C10,C11,C13,C14,C18,C2,C22,C24,C27,C28,C30,C32,C34,C37,C38,C40,C42,C43,C44,C46,C48,C49,C51,C52,C53,C57,C6,C60,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C71,C72,C74,C77,C79,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D5,D9
`Chr2:161755`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B30,C22,C40,C44,C53
`Chr2:161755`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B30,C22,C40,C44,C53
`Chr2:161759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,C22,C40,C44,C53
`Chr2:161882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:161963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,D9
`Chr2:161997`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A2,B124,B20,B29,B40,B71,C58
`Chr2:162019`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A14,C51,C74,C83
`Chr2:162019`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A14,C51,C74,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796392.1

126 aa

126

RRM_5

RRM_1

PF13893 RRM_5 18-98 aa PF00076 RRM_1 22-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796392.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	18	98	1.1e-07	32.3	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057796392.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	22	88	2.1e-18	66.7	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940409.1
AATTGCCATTTTTCATTCCATGCGTTTCAAGACATCTCCACTGGTGTTTTTGATCATCAAATCAATAATCAAACCACAACCTTTCATCGGAATTTTCAATTCCGGTTGTATATGTTCAGTTTCATCCCCGAATTCAGATTGATTTGTGACAATAAATAGCCATTTCTTGTTCCATGCGTTTCAGATATCTCCATACCACCATCTTGCGCTCGTCGCGGAACAGATGAAGAATAACAAGTGTTTTTTGTTTAGTCCCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012452
ATGGCCGCAGCAATCAGCCTCCGCAAAGGCAACACCCGCCTCCCGCCCGAGGTGAACCGCGTGCTCTATGTGCGGAACCTTCCGTTCAACATCACGAGCGAGGAGATGTACGACATCTTCGGCAAGTACGGCGCGATACGGCAGATCCGCATTGGCACGAACAAGGACACTCGCGGCACCGCCTTCGTTGTGTACGAGGATATCTATGACGCCAAGACCGCCGTCGACCACCTCTCCGGCTTCAACGTCGCGAACCGGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796392.1
MAAAISLRKGNTRLPPEVNRVLYVRNLPFNITSEEMYDIFGKYGAIRQIRIGTNKDTRGTAFVVYEDIYDAKTAVDHLSGFNVANRYLIVLYYQQAKMGKKFDQKKKEEEIQKLQEKYGISTPKDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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