当前解析结果
SmilChr02G000030| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000030 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000030 |
| 描述 | protein LURP-one-related 4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 369559 - 370816 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012502 |
|---|---|
| GeneID | 131012502 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012502 |
| 原始查询 | SmilChr02G000030 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein LURP-one-related 4-like |
| 产物 | protein LURP-one-related 4-like |
| Arabidopsis | AT1G63410 (AT1G63410)LURP-one-like protein (DUF567) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842647] identity=44.6; qcov=0.99; evalue=1.7e-48; confidence=medium |
| Rice | Os07g0672600 (P0470D12.133)- identity=36.8; qcov=1.08; evalue=7.12e-35; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04525 (LOR) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012502 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796483.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057796483.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057796483.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796483.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796483.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:370206 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B2,C1,C34 |
Chr2:370496 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C75 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057796483.1PF04525
LOR 24-190 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057796483.1 |
Pfam | PF04525 |
LOR | Domain | 24 | 190 | 6.7e-31 | 108.7 | LURP-one-related |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。