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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000033`

染色体: Chr02 坐标: 405610-406701 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000033`
名称	SmilChr02G000033
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	405610 - 406701 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013377`
GeneID	`131013377`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013377`
原始查询	`SmilChr02G000033`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=37.6; qcov=0.645; evalue=9.75e-40; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=36.8; qcov=0.741; evalue=6.32e-51; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13173 (AAA_14); PF13401 (AAA_22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013377

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057797426.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057797426.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797426.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797426.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797426.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:405661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C61
`Chr2:405664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr2:405670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C74
`Chr2:405671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:405692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B65,C74
`Chr2:405716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B14,B83,C65,C87
`Chr2:405717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B42,B43
`Chr2:405747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:405762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C74
`Chr2:405769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D4,D7
`Chr2:405807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr2:405812`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B60,C27,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797426.1

363 aa

182

363

NB-ARC

AAA_22

AAA_14

PF00931 NB-ARC 134-295 aa PF13401 AAA_22 143-235 aa PF13173 AAA_14 146-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797426.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	134	295	1.4e-44	152.4	NB-ARC domain
`XP_057797426.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	143	235	4.9e-07	30.8	AAA domain
`XP_057797426.1`	Pfam	`PF13173`	AAA_14	Family	146	257	5.4e-07	30.4	AAA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941443.1
ATGATTGAATCTCACATCGTCAATCAAATCCTTCCTCTATCAGCTCATGATCGAGAAGCGGCTTTGAGTTTCCCGTTGTATCTACAGAAAAAAAGGGCAACTGAAGAGAAAAATGCACCAGCAGTTGGAGATGGATGCTGGATCAATTTCATGCAGCTCATTAAGAATCAATTAGAGAGAAAGAAGAGGCAATTGAAGAAAAAAACGCACCAAGCAAACCTTAGCTGCTTGGAGTATCTGCGGCAGATAATTGAAGACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013377
ATGATTGAATCTCACATCGTCAATCAAATCCTTCCTCTATCAGCTCATGATCGAGAAGCGGCTTTGAGTTTCCCGTTGTATCTACAGAAAAAAAGGGCAACTGAAGAGAAAAATGCACCAGCAGTTGGAGATGGATGCTGGATCAATTTCATGCAGCTCATTAAGAATCAATTAGAGAGAAAGAAGAGGCAATTGAAGAAAAAAACGCACCAAGCAAACCTTAGCTGCTTGGAGTATCTGCGGCAGATAATTGAAGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797426.1
MIESHIVNQILPLSAHDREAALSFPLYLQKKRATEEKNAPAVGDGCWINFMQLIKNQLERKKRQLKKKTHQANLSCLEYLRQIIEDMDAIIEKANELKEKQRLREDQPPTHSTPLYTETREESGMVGFHDELIQLLDELTGHRSNRQIISIVGMGGMGKTTLAKHIYSNQLIIEHFDIRAWATVSQQDIAKQILQQLLSGQEKSSDQDVDKLGVQLHKTLFGRRYLIILDDIWSVEAWDEVNRFFPDNRNGSRILLTTRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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