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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000045`

染色体: Chr02 坐标: 611725-614055 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000045`
名称	SmilChr02G000045
描述	ATP synthase small subunit 6-A, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	611725 - 614055 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012514`
GeneID	`131012514`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012514`
原始查询	`SmilChr02G000045`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP synthase small subunit 6-A, mitochondrial-like
产物	ATP synthase small subunit 6-A%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G46430` (AT3G46430) ATP synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823793] identity=72.7; qcov=0.902; evalue=5.2e-27; confidence=medium
Rice	`Os03g0606200` (RMtATP6) - identity=72.2; qcov=0.885; evalue=7.99e-26; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30978 (ATP_synth_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012514

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796494.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057796494.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057796494.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796494.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796494.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:612013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B107,B113,B119,B31,B47,B48,B55,B85,C23,C30,C39,C50,C65,C7,C79,D4
`Chr2:613579`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A6,A7,B105,B21,B36,B45,C26,C53,C55,C77
`Chr2:613585`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B1,B126,B33,B54,B65,B7,B79,B83,B93,B95,C17,C44,C83,D2
`Chr2:613782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C24,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796494.1

71 aa

ATP_synth_6

PF30978 ATP_synth_6 1-51 aa

XP_057796496.1

61 aa

ATP_synth_6

PF30978 ATP_synth_6 1-51 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796494.1`	Pfam	`PF30978`	ATP_synth_6	Family	1	51	5.2e-35	119.5	Mitochondrial ATP synthase 6 kDa subunit
`XP_057796496.1`	Pfam	`PF30978`	ATP_synth_6	Family	1	51	3.7e-35	119.9	Mitochondrial ATP synthase 6 kDa subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940511.1
AAATATTTCAACATCAATCATGTAGATCTCGCCTAGGGTAAAAGTAAAACCACGTTAATGGGCCAAGCCCATGTGGGTAAATCTGGTGTGCTCGGTCGCCCAATATAATAGAAGTGGAAGCCGATTATACCACCGTATAAGCATTTCGCATTACATCTTCAAGAGAGAGAAAAAAAAAAAACAGTCGCTATGAGGAAATTTGATCCGTGGCCGGTGTTTTTCAAGAGAGAATGGAACCGCTGCTGGCCATTCCTCGTCGG...

XM_057940513.1
AAGTAAAACCACGTTAATGGGCCAAGCCCATGTGGGTAAATCTGGTGTGCTCGGTCGCCCAATATAATAGAAGTGGAAGCCGATTATACCACCGTATAAGCATTTCGCATTACATCTTCAAGAGAGAGAAAAAAAAAAAACAGTCGCTATGAGGAAATTTGATCCGTGGCCGGTGTTTTTCAAGAGAGAATGGAACCGCTGCTGGCCATTCCTCGTCGGATTCGCAGTCACTGGCACCATTGTCACTAAGTTTTCCCTTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012514
ATGAGGAAATTTGATCCGTGGCCGGTGTTTTTCAAGAGAGAATGGAACCGCTGCTGGCCATTCCTCGTCGGATTCGCAGTCACTGGCACCATTGTCACTAAGTTTTCCCTTAGTCTCACCGAGGAGGATGCGAAGAACTCTCCGTTCGCGCAAGCACACAAAAAGCGTTGGGGTGACAAATATTAA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796494.1
MRKFDPWPVFFKREWNRCWPFLVGFAVTGTIVTKFSLSLTEEDAKNSPFAQAHKKRKFVCLFFVFRSGCKP

XP_057796496.1
MRKFDPWPVFFKREWNRCWPFLVGFAVTGTIVTKFSLSLTEEDAKNSPFAQAHKKRWGDKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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