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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000052`

染色体: Chr02 坐标: 694513-698468 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000052`
名称	SmilChr02G000052
描述	switch 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	694513 - 698468 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012462`
GeneID	`131012462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012462`
原始查询	`SmilChr02G000052`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	switch 2-like
产物	switch 2-like
Arabidopsis	`AT1G03750` (SWI2) switch 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839417] identity=65.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0247900` (CSB) - identity=61.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0140658 (ATP-dependent chromatin remodeler activity)
KEGG	-
Pfam	PF00176 (SNF2-rel_dom); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796399.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796399.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796399.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796399.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796399.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:694680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:694683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr2:694808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,C2,C32,C68
`Chr2:694823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,C2,C32,C68
`Chr2:694857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B108,B126,C14
`Chr2:694877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr2:694895`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr2:694895`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr2:695157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:695201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,C58,C9
`Chr2:695653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:696341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796399.1

861 aa

430

861

ResIII

SNF2-rel_dom

Helicase_C

PF04851 ResIII 138-307 aa PF00176 SNF2-rel_dom 139-414 aa PF00271 Helicase_C 532-644 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796399.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	138	307	2.2e-07	31.6	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057796399.1`	Pfam	`PF00176`	SNF2-rel_dom	Domain	139	414	2.2e-65	221.4	SNF2-related domain
`XP_057796399.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	532	644	1.7e-26	93.3	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940416.1
GAAGCTTTGGAAAGAGTCGATGGCGGTTCCACCGAATAAACATGCACTGAAATCGTGAAAAAGTAACTCCCAAAAATTCAGCAATTCCAATTTCCATGTCATTGAACGCTTTCAAGGAGGCGCTCAAGCCCTGCAAATCCACTGTAACGCCGTCCCAATCATCTCCATCTTCTTCGCGAATTTCTCTAGGTTTTGACCCCTCAATTCCACTAAGAAAGCCCCCCAAATCCTCGCTGTCCCGCCAACTTCTCCGCCTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012462
ATGTCATTGAACGCTTTCAAGGAGGCGCTCAAGCCCTGCAAATCCACTGTAACGCCGTCCCAATCATCTCCATCTTCTTCGCGAATTTCTCTAGGTTTTGACCCCTCAATTCCACTAAGAAAGCCCCCCAAATCCTCGCTGTCCCGCCAACTTCTCCGCCTCCACGATGCTGCCGATTTCTCGCCGCCAAACGAACTCAAAATATCGAAACCGGAGCCCAATTCGAGCGCCGGAAGCAGAAATGATAAATGCGAGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796399.1
MSLNAFKEALKPCKSTVTPSQSSPSSSRISLGFDPSIPLRKPPKSSLSRQLLRLHDAADFSPPNELKISKPEPNSSAGSRNDKCEEEEKEAEIRPRAIKLESSRSFDHTGPYEPLLLSLPGEIPVVQVPASINSRLLEHQRVGVKFLYNLYKNNHGGILGDDMGLGKTIQTIAFLAAVFGKGSDESDTVLTSHNGNRVEKKGPVLIICPSSVILNWESEFSKWSTFSVAVYHGVNRDLVIDKLKADDVEIIITSFDTYRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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