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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000053`

染色体: Chr02 坐标: 700214-706940 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000053`
名称	SmilChr02G000053
描述	signal peptide peptidase-like 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	700214 - 706940 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012475`
GeneID	`131012475`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012475`
原始查询	`SmilChr02G000053`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	signal peptide peptidase-like 3
产物	signal peptide peptidase-like 3
Arabidopsis	`AT2G43070` (SPPL3) SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818909] identity=59.9; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0433200` - identity=58.7; qcov=0.841; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005765 (lysosomal membrane); GO:0030660 (Golgi-associated vesicle membrane); GO:0033619 (membrane protein proteolysis); GO:0042500 (aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving); GO:0098553 (lumenal side of endoplasmic reticulum membrane); GO:0098554 (cytoplasmic side of endoplasmic reticulum membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02225 (PA); PF04258 (Peptidase_A22B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012475

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057796424.1`
2	Lysosome membrane	溶酶体膜	0.20000	`XP_057796424.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057796424.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057796424.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057796424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:700637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:702959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,D8
`Chr2:703047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:705768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C11,C69
`Chr2:705779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B52,B57,B91,C32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796424.1

541 aa

270

541

Peptidase_A22B

PF02225 PA 94-171 aa PF04258 Peptidase_A22B 245-525 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796424.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	94	171	1.9e-13	51.1	PA domain
`XP_057796424.1`	Pfam	`PF04258`	Peptidase_A22B	Family	245	525	3.4e-98	329.5	Signal peptide peptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940441.1
CTAAAGATGCAAACTGTACACAATTCAAAATTATAGGGTGCAGATTGTTAATTACCACGATCTCCCAATTTCCCCAAAAATAATTTTCTGGTTTCTTTGATCCTTCACATGTAATTCCCTCCGCCTCGAAATCATATGCACAAATCGCAAGCCCATGATATGCATTCTAGCTTCGACTGATTAATCAGCAGAATTCCTAACATTAGGTATGGCTGCAGCATCTCAACGGTCGTTGAGTTTAGTTGTTGCATTGCAATTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012475
ATGGCTGCAGCATCTCAACGGTCGTTGAGTTTAGTTGTTGCATTGCAATTGGGGATTCTTTTGTTGTTCCTGTCATCAATTGCTGTCGGAGATGACGTTTCGCGAGCTTCCCCCGACGACGAATCCGCCGCCTGCGGGAACGACTTCCGATTGGTTAAGGTCAAAAGGTGGGTAGATGGTGTGGAGAAGGAGGCAATAGGTGGGCTAACTGCTGATTTTGGGTCTGTGTTGCCTGCTAATGCTAAAGAAGGCCACCGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796424.1
MAAASQRSLSLVVALQLGILLLFLSSIAVGDDVSRASPDDESAACGNDFRLVKVKRWVDGVEKEAIGGLTADFGSVLPANAKEGHRFSAVFADPLNGCSLSSSNVSGSIALTVRGDCIFTTKAKVAQAGAAAALIVINDEEGLVQMGCGNDTTLNITIPVITISKSGGEELKKSMASGGKVELLLYSPDRPILDYSVIFLWLMAVGTVVSASLWSEITGSKRSDEHYNELSPQDSGTAADKDEEEKEILHISAKSAIVFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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