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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000059`

染色体: Chr02 坐标: 755774-756272 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000059`
名称	SmilChr02G000059
描述	60S ribosomal protein L14-2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	755774 - 756272 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012507`
GeneID	`131012507`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012507`
原始查询	`SmilChr02G000059`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L14-2-like
产物	60S ribosomal protein L14-2-like
Arabidopsis	`AT4G27090` (AT4G27090) Ribosomal protein L14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828817] identity=82.4; qcov=0.963; evalue=8.42e-73; confidence=high
Rice	`Os04g0515300` - identity=79.5; qcov=0.971; evalue=1.06e-73; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit); GO:0042273 (ribosomal large subunit biogenesis)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01929 (Ribosomal_L14e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012507

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796488.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796488.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796488.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796488.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796488.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:755934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B105,B137
`Chr2:756041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:756043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:756075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr2:756084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:756231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B32,B51,C58
`Chr2:756241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B97,C74
`Chr2:756264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:756267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B51,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796488.1

136 aa

136

Ribosomal_L14e

PF01929 Ribosomal_L14e 45-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796488.1`	Pfam	`PF01929`	Ribosomal_L14e	Family	45	117	1e-22	81.1	Ribosomal protein L14

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940505.1
ATGTCGTTCAAGAGGTACGTCGAGATTGGGAGGGTGGCCCTCGTCAACTACGAAAAAGACTATGGCAAGCTTGTCGTCATCGTTGATGTTATCGACCAGAGCAGGGCTCTTGTTGACTCACCTGACATGGTAAGAAGACAGATGAATTTCAAGAGGCTTTCTCTTACAGACATCAAAATTGACATCAAGAGGGTGCCGAAGAATAAGACTCGTGTTGCTGCTATGGAGGCTGTTGATGTTAAGGGAAAATGGGAAAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012507
ATGTCGTTCAAGAGGTACGTCGAGATTGGGAGGGTGGCCCTCGTCAACTACGAAAAAGACTATGGCAAGCTTGTCGTCATCGTTGATGTTATCGACCAGAGCAGGGCTCTTGTTGACTCACCTGACATGGTAAGAAGACAGATGAATTTCAAGAGGCTTTCTCTTACAGACATCAAAATTGACATCAAGAGGGTGCCGAAGAATAAGACTCGTGTTGCTGCTATGGAGGCTGTTGATGTTAAGGGAAAATGGGAAAGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796488.1
MSFKRYVEIGRVALVNYEKDYGKLVVIVDVIDQSRALVDSPDMVRRQMNFKRLSLTDIKIDIKRVPKNKTRVAAMEAVDVKGKWESNSWGRKLIVQKRRAALNDFDRFKLMLAKIKKAGVVRQELAKLKKETILYE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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