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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000063`

染色体: Chr02 坐标: 798142-801843 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000063`
名称	SmilChr02G000063
描述	expansin-B3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	798142 - 801843 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012498`
GeneID	`131012498`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012498`
原始查询	`SmilChr02G000063`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-B3-like
产物	expansin-B3-like
Arabidopsis	`AT4G28250` (EXPB3) expansin B3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828940] identity=72.9; qcov=1.02; evalue=7.58e-140; confidence=high
Rice	`Os02g0639500` - identity=76.8; qcov=0.937; evalue=3.31e-131; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006949 (GO:0006949); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0019953 (sexual reproduction)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012498

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057796478.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057796478.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796478.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796478.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796478.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:798494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr2:798566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B37,B82,C60,C63
`Chr2:799407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C60
`Chr2:801154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:801187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B90,B97,C13,C8
`Chr2:801238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796478.1

253 aa

126

253

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 63-141 aa PF01357 Expansin_C 155-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796478.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	63	141	4.6e-16	59.5	Lytic transglycolase
`XP_057796478.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	155	236	8.1e-26	90.7	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940495.1
AAACAAAAAAATAAAAATAAAAGCAACAGAAATTCCTCAGTCGCTTAAGCTCAGTTCCTTCCTTCCACACTGCTCCAAACTGTCGGCACTTTCCCGCCTCGATTTTCACGCGCCGCCGTGAAATCAGTTGCTGCGCTTTGCCCCACATTATGGAGAGCCTCTGTTGCCTTCTCGTTTTCTGCATTCTGCTCGGCTCCGCCGCCGCGGCGGGGGACCTGCATTGGTCCCCGGCGACGGCGACGTGGTACGGCAGCCCCGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012498
ATGGAGAGCCTCTGTTGCCTTCTCGTTTTCTGCATTCTGCTCGGCTCCGCCGCCGCGGCGGGGGACCTGCATTGGTCCCCGGCGACGGCGACGTGGTACGGCAGCCCCGAGGGCGACGGCAGCGACGGAGGCGCGTGCGGCTACGGATCGCTGGTGGACGTGAAGCCGTTCCGCGCGCGCGTCGGCGCGGTGAGCCCGGTGCTCTTCAAGGGCGGCGAGGGCTGCGGCGCCTGCTACAAGGTGCGGTGCCTCGACCGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796478.1
MESLCCLLVFCILLGSAAAAGDLHWSPATATWYGSPEGDGSDGGACGYGSLVDVKPFRARVGAVSPVLFKGGEGCGACYKVRCLDRSICSRRAVTVIITDECPGGYCSGGRTHFDLSGAAFGRMAVSGNGGQLRNRGEIPVIFRRTPCKYPGKNIAFHVNEGSTNYWLSLLVEFEGGDGDVGSMHIREANSNQWLEMTHIWGASWCIIAGPLQGPFSVRLTTLSTGKTLSAREVIPRNWAPKATYTSRLNFNN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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