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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000069`

染色体: Chr02 坐标: 883370-884867 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000069`
名称	SmilChr02G000069
描述	uncharacterized SmilChr02G000069
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	883370 - 884867 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013658`
GeneID	`131013658`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013658`
原始查询	`SmilChr02G000069`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013658

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797767.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797767.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797767.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797767.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:883386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr2:883413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C75,C82,D11
`Chr2:883414`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	C3,C48,C52,C61
`Chr2:883414`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	C3,C48,C52,C61
`Chr2:883419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C8
`Chr2:883424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A1,A11,A16,B108,B118,B12,B123,B129,B130,B18,B2,B20,B22,B35,B36,B8,B83,B85,B93,C19,C23,C25,C48,C5,C50,C54,C58,C59,C65,C66,C75,C8,C83,D1
`Chr2:883433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	135	A1,A11,A14,A15,A20,A21,A23,A25,A3,A4,A6,A8,B100,B105,B106,B107,B108,B111,B112,B118,B119,B120,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B13,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B14,B15,B16,B2,B20,B21,B22,B23,B26,B27,B28,B30,B31,B32,B35,B36,B38,B40,B44,B45,B46,B49,B57,B58,B59,B6,B61,B64,B65,B66,B69,B7,B71,B72,B75,B76,B77,B78,B83,B87,B88,B89,B9,B92,B94,B95,B96,B97,B98,C10,C11,C15,C19,C20,C21,C24,C25,C26,C27,C29,C30,C31,C32,C34,C38,C39,C4,C41,C43,C44,C45,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C67,C68,C7,C70,C72,C75,C76,C78,C79,C82,C85,C87,D10,D11,D5
`Chr2:883446`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A1,A11,A16,A20,A9,B108,B118,B12,B123,B129,B130,B18,B2,B20,B21,B22,B35,B36,B78,B83,B85,B93,C19,C23,C25,C48,C49,C5,C50,C54,C58,C59,C65,C66,C8,C83,D1,D3
`Chr2:883451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:883473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B24,C18,C75
`Chr2:883475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C42
`Chr2:883490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A2,A23,A5,A9,B100,B129,B135,B140,B29,B59,B84,B94,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797767.1

345 aa

172

345

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 144-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797767.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	144	231	2e-09	38.4	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941784.1
ATGTCTCATCGTAGAGGGCTTTTGGGGTTTGGTAGTCGGTCTTCTGGGCCTGAGCAGGAGCGACAGTCCTCCTCAGGCTCTGGGCCGTACATTTCTGCGACTCCAGAGAGTTCCACTCCACAGACCGTTGCTGCATCTGGTAACTTGATCGAGCCCCTGGGGATCTCCACCAATTGCACGAACTCGTTTAAGAGGATTCCGAACCCAGGCGGGTACACGTGGAAGTTAACTCCGCCAACGGTGCAGGACTTGTATTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013658
ATGTCTCATCGTAGAGGGCTTTTGGGGTTTGGTAGTCGGTCTTCTGGGCCTGAGCAGGAGCGACAGTCCTCCTCAGGCTCTGGGCCGTACATTTCTGCGACTCCAGAGAGTTCCACTCCACAGACCGTTGCTGCATCTGGTAACTTGATCGAGCCCCTGGGGATCTCCACCAATTGCACGAACTCGTTTAAGAGGATTCCGAACCCAGGCGGGTACACGTGGAAGTTAACTCCGCCAACGGTGCAGGACTTGTATTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797767.1
MSHRRGLLGFGSRSSGPEQERQSSSGSGPYISATPESSTPQTVAASGNLIEPLGISTNCTNSFKRIPNPGGYTWKLTPPTVQDLYFEEFKKEFTWNPDDEADVKKIWLKNVRKRYSDNMSEYKRQLKEKTEAGEMMETPLGMSDTFWTGLNAYWDQDEVKAVSRRARENRYSEPDGVGTRISRHVGGSQSSRILQQSLLLDGEVPPTTSIYNTFLRLHMLADGTFVSKKDAKLDIHRVAAETGREDRLDEVYLELVRPGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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