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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000079`

染色体: Chr02 坐标: 1032482-1036094 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000079`
名称	SmilChr02G000079
描述	uncharacterized SmilChr02G000079
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1032482 - 1036094 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012480`
GeneID	`131012480`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012480`
原始查询	`SmilChr02G000079`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ist1p [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28718274]; symbol=AT2G14830; hit=AT2G14830; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ist1p [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28718274]; symbol=AT2G14830; hit=AT2G14830; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G14830` (AT2G14830) Ist1p [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28718274] identity=50.3; qcov=0.42; evalue=1.99e-57; confidence=low
Rice	`Os08g0175200` - identity=35.3; qcov=0.438; evalue=2.29e-35; confidence=low
GO	GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF03398 (Ist1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012480

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057796430.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057796430.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057796430.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796430.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796430.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1032977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:1033059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:1033156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:1033195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,A9,B52,C62
`Chr2:1033214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C35
`Chr2:1033220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr2:1033231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:1033262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr2:1033302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:1033306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B66,D11,D9
`Chr2:1033377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B98,C18
`Chr2:1033403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796430.1

459 aa

230

459

Ist1

PF03398 Ist1 15-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796430.1`	Pfam	`PF03398`	Ist1	Family	15	174	2.5e-46	158.3	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940447.1
GCTCAACTATTCTTTGACTCCTATCTTCTTATTTTAGTTTTAGTTTTCGACCTAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAAAAAGTAGTGGAGTTAGTTTCCATAGAGTGGTGAAGCACGCTATTCTTTTCTCTGTCATCTAATTTTTAATATTTTTATCTAAATATTTATTTATATATTCAAAATCTCTCTCTCTCCTGCACCCCACCCCACCCACTCCCCTCCTAAAAATAACTGCCGGGAAAATGTAAAACCCTCAACTCCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012480
ATGTTTAATATTCTGTTTGGATGGACAAAGGCTTCGAAATGTAAGAAACTGATAAAGAGGGTGCAGTGTCGGCTGAAACTGCTCAAGAGCAAGAGGAGTTGCATTGTGAAGCAGCTGAGAAACGACGTCGCCGAGCTTCTCAAGCACGGCCACGATCAAGCCGCTTTTGATAGGGTAGAGCAAGTTGTGATTGATGAAAATATGGTTCAAGTATATGATCTGCTGTACCAGTTTTGTGAATTTATAATCATTAATCTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796430.1
MFNILFGWTKASKCKKLIKRVQCRLKLLKSKRSCIVKQLRNDVAELLKHGHDQAAFDRVEQVVIDENMVQVYDLLYQFCEFIIINLPYIRKHRDCPNDINEAASTLIFSSARFGELPELLSLRKLFDSRYGQKFVTTALELLPGNLVSTQIIENLDMKSVPDNVKYKFLDEISRSCIEAGPLFLEYKPHLQENEMGDQNDIVRGDRERDGKIMYEDLLKINEEKKFWKKSCFGLRKEVDFGNHEMETSSENSAKLGEEVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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