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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000085`

染色体: Chr02 坐标: 1122561-1123919 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000085`
名称	SmilChr02G000085
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1122561 - 1123919 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007559`
GeneID	`131007559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007559`
原始查询	`SmilChr02G000085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=32.7; qcov=1; evalue=2.24e-88; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=37.9; qcov=1.01; evalue=8.3e-112; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790452.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057790452.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790452.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790452.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790452.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1122901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr2:1122989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr2:1123004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B16,C15,D9
`Chr2:1123070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:1123080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C27
`Chr2:1123080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:1123084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,B56
`Chr2:1123149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A3,B103,B108,B120,B140,B21,B33,B44,B68,B75,B86,B95,C29,C33,C4,C43,C83
`Chr2:1123161`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A11,A23,B13,B130,B23,B32,B36,B62,B88,B96,C13,C30,C31,C36,C47,C74,D1
`Chr2:1123174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C4,C71
`Chr2:1123174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C71
`Chr2:1123175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A2,A3,B10,B110,B111,B115,B120,B127,B139,B18,B26,B3,B66,B71,B77,B95,B98,C16,C22,C3,C32,C4,C45,C5,C56,C62,C76,C86,D3,D5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790452.1

452 aa

226

452

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 83-199 aa PF10551 MULE 116-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790452.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	83	199	2.4e-13	50.9	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057790452.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	116	210	9.8e-29	100.3	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934469.1
ATGCATCGTTCTAATAGAACAATTAGCGATGAAAATGCTGTCATTATTGAAGATATGTTATCATCTGGGATAGGAGCCACTGATGCTTATAGATATATGGCGCAAGAAGCAGGGGGTGAGGACATGATTCGCTATACAAAGAGAGATTGTATAAACTATGTGAATAGGCTGAAAATCTTAACAATAGAAGGAGGTGATGCTCAAACACTTTTGAACATTTTAGAAGATCAATCTGCTGAAAATGATGACTTCTTTTATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007559
ATGCATCGTTCTAATAGAACAATTAGCGATGAAAATGCTGTCATTATTGAAGATATGTTATCATCTGGGATAGGAGCCACTGATGCTTATAGATATATGGCGCAAGAAGCAGGGGGTGAGGACATGATTCGCTATACAAAGAGAGATTGTATAAACTATGTGAATAGGCTGAAAATCTTAACAATAGAAGGAGGTGATGCTCAAACACTTTTGAACATTTTAGAAGATCAATCTGCTGAAAATGATGACTTCTTTTATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790452.1
MHRSNRTISDENAVIIEDMLSSGIGATDAYRYMAQEAGGEDMIRYTKRDCINYVNRLKILTIEGGDAQTLLNILEDQSAENDDFFYRVRLDEDGRLNHVFWRDSMMKDDFTIFGDVMVFDTTYRTNKYNLICAPFVGLNNYKKNVMFGCAFLSNEKIETFVCLFETFKKSMGGRSPISLFTDQDLAMSKAIEKVFPQTRHRLCIWHLHQNAQSHLGKLKSDKTFYDAFQRCITGCIDSYDFEECWKAMVENHNLQNNSWI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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