当前解析结果
SmilChr02G000088| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000088 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000088 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000088 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 1143230 - 1144140 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007561 |
|---|---|
| GeneID | 131007561 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007561 |
| 原始查询 | SmilChr02G000088 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007561 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790455.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057790455.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790455.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790455.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790455.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:1143247 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B21,C3 |
Chr2:1143268 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C76 |
Chr2:1143490 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B139 |
Chr2:1143490 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
Chr2:1143503 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr2:1143539 |
GAT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 36 | A16,A22,A9,B10,B103,B109,B114,B118,B122,B137,B139,B2,B24,B31,B42,B5,B55,B64,B76,B94,C13,C2,C24,C26,C29,C32,C35,C4,C42,C5,C50,C56,C68,C87,D2,D5 |
Chr2:1143566 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C38 |
Chr2:1143573 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr2:1143599 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:1143614 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B33 |
Chr2:1143647 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B4,B91,C30,C60 |
Chr2:1143663 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B91,C30,C60 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。