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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000091`

染色体: Chr02 坐标: 1177467-1178837 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000091`
名称	SmilChr02G000091
描述	uncharacterized SmilChr02G000091
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1177467 - 1178837 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007563`
GeneID	`131007563`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007563`
原始查询	`SmilChr02G000091`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=26.2; qcov=0.511; evalue=3.14e-14; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=31.6; qcov=0.388; evalue=4.02e-20; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007563

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790456.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057790456.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057790456.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057790456.1`
5	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057790456.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1177500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:1177553`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B34,B44
`Chr2:1177553`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B34,B44
`Chr2:1177600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B34
`Chr2:1177600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:1177697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:1177734`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B13,B34,B41,C12,C22,D7
`Chr2:1177753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B41,C12,C22
`Chr2:1177779`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B118,B21,B37,B40,B75,B82,C15,C38,C45,C65,C74
`Chr2:1177859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A10,B118,B133,B17,B21,B40,B59,B69,B85,B90,B92,C10,C38,C41,C65,C74,D1
`Chr2:1177896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B44
`Chr2:1178008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790456.1

456 aa

228

456

DUF4283

PF14111 DUF4283 36-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790456.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	36	113	6e-10	39.4	Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934473.1
ATGGATCAAGATGAGATACGACGTCTTGTGGACAAACTGAAGTTGGAGGAGGAGGCGGACGCGAGTATTGTGAATCTATCACAAACTTTGTCAGAAAATTTACGGCAAAATACGAAGCTTTGTTTGGTGGGGAAGGTGTTCGCGGGGCATCAGATTAGTCGGGAGTTAATTGCGAATCATTTACCAAACATTCTCCAAGCGAAACAACGTGTGGATATTGAGATAGTGGGGGCGAATATCTTTGTTGCTTTATTTGCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007563
ATGGATCAAGATGAGATACGACGTCTTGTGGACAAACTGAAGTTGGAGGAGGAGGCGGACGCGAGTATTGTGAATCTATCACAAACTTTGTCAGAAAATTTACGGCAAAATACGAAGCTTTGTTTGGTGGGGAAGGTGTTCGCGGGGCATCAGATTAGTCGGGAGTTAATTGCGAATCATTTACCAAACATTCTCCAAGCGAAACAACGTGTGGATATTGAGATAGTGGGGGCGAATATCTTTGTTGCTTTATTTGCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790456.1
MDQDEIRRLVDKLKLEEEADASIVNLSQTLSENLRQNTKLCLVGKVFAGHQISRELIANHLPNILQAKQRVDIEIVGANIFVALFASVLDKKHALLGGPWHLFQDLLLFKELEGFQNPADVRFDEFTGWVQCHNLPIACMHPDVVRRIGEQIGFVEEIDMGVGGLCMGRFARVRVRWQLENPLKRCVRIVPDGEMEGAIVLLLYDKLPNFCFACGKIGHLVRFCEDTKVDKGGDLKFGTWLMAAKPQETRRKLAMGNLPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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