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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000095`

染色体: Chr02 坐标: 1236911-1239822 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000095`
名称	SmilChr02G000095
描述	altered inheritance of mitochondria protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1236911 - 1239822 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012470`
GeneID	`131012470`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012470`
原始查询	`SmilChr02G000095`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	altered inheritance of mitochondria protein 3-like
产物	altered inheritance of mitochondria protein 3-like
Arabidopsis	`AT5G14540` (AT5G14540) basic salivary proline-rich-like protein (DUF1421) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831305] identity=40.1; qcov=0.527; evalue=9.95e-52; confidence=medium
Rice	`Os05g0169400` - identity=38.6; qcov=0.968; evalue=1.08e-83; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07223 (DUF1421)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012470

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057796410.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796410.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057796410.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057796410.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057796410.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1237339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B30,C42
`Chr2:1237340`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C59
`Chr2:1237340`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C59
`Chr2:1237570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:1237743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:1237791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B34,B36
`Chr2:1237794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:1237997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C30
`Chr2:1238056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B51,C3,C42
`Chr2:1238099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C26
`Chr2:1238291`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C56
`Chr2:1238291`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796410.1

586 aa

293

586

DUF1421

PF07223 DUF1421 531-574 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796410.1`	Pfam	`PF07223`	DUF1421	Domain	531	574	1.8e-19	70.0	UBA-like domain (DUF1421)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940427.1
ACTAGCGACTTTAGCTCAAAATATCACTTAACCTTCCGCGACAAGTAATGCAGACGACTCCACACTCGTCATCTTCTTCCTCCCATCGTTTTATTTTTCATTTTTTTTTTCTGTTTAATTATTCCAAAAACATATCCAAAATCGAGCATCTTTTCCAAAACCCTAATCCCAAAATTCCCCATTTCTGCTTCGAGCTATATTTAAGCGCCAGCAGTTTGATTCGATTTTGGTCGATTGAGGACTCAGATGAATAACAGTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012470
ATGAATAACAGTACGGCGTCTCAGTACATGGACAAGCAGATCATGGATCTCTCCAATTCCCAGAGCAACATCGCCGGCAGCAATGGCGGCGGCGGCGCGGATTTCATCGATTTCATGAACCGCCCCGCGGAGAAGAAGGAGGACATGGTCCCGAGCTACGATTTCATGCCGATTCGACCCGCCACCGCCGCGGCGTCGTCGTCGTCGTCGCCCAAGGCCGCTCGCTCGAACTTCGACTCGGACAATGACGATCCTCCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796410.1
MNNSTASQYMDKQIMDLSNSQSNIAGSNGGGGADFIDFMNRPAEKKEDMVPSYDFMPIRPATAAASSSSSPKAARSNFDSDNDDPPLRTWNSVDSKANSSPIRNYNSVDVDEPAKFVLGKNHKTGSAPLDGTLVSDIERMMKKHMDNLIHAIDNMSSRLSQLETRSRNLEHSIDDLKTSVGNNHGAIDGKMRLLENILTEVQSGVKVVRDKQDIVEAQLQIAKMQLPKAEHIESKINAQPDPMQTGVPTQHQFSNVPLTQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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