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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000100`

染色体: Chr02 坐标: 1292606-1292941 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000100`
名称	SmilChr02G000100
描述	putative cell wall protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1292606 - 1292941 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007567`
GeneID	`131007567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007567`
原始查询	`SmilChr02G000100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative cell wall protein
产物	putative cell wall protein
Arabidopsis	`AT2G20870` (AT2G20870) cell wall protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816620] identity=50.7; qcov=0.658; evalue=7.32e-13; confidence=low
Rice	`Os07g0565800` (OJ1773_H01.114) - identity=46; qcov=0.685; evalue=2.53e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29014 (Put_cell_wall)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790459.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790459.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790459.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790459.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790459.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1292642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B54,B82,B95
`Chr2:1292653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:1292659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B114,B82,B93,B95
`Chr2:1292670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B139,B2,B34,B59
`Chr2:1292676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B72,B82,B95
`Chr2:1292680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B82,B89,B95
`Chr2:1292685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B82
`Chr2:1292686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B82,B95
`Chr2:1292689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:1292692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B82,B91,B95
`Chr2:1292713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,C18,C78,C9,D5
`Chr2:1292714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B82,B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790459.1

111 aa

111

Put_cell_wall

PF29014 Put_cell_wall 6-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790459.1`	Pfam	`PF29014`	Put_cell_wall	Family	6	111	9.5e-14	52.2	Putative cell wall protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934476.1
ATGGCATCCTCCTCTTTCTTCCTCCTCTTCCTTCTCGTCTCGTCTCTGGCCCTCGAGGCAGCCGCGGGGCGGGACGTCCCGACGGACGATGCCAAATTTTCCCACGACGGCACGGTGTGGGTCCCAGGCCTCGGCCGTTTCATGCTCCCCAAGAAAGGCTCCAAGTCCTTGGACTACAATCCCATCACCGGAGCCCCGGGAGGGAACGGCGTCTCCATCCCCGGGATCGGCGGCCGCAGCAATATCCCCGGCGGAGACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007567
ATGGCATCCTCCTCTTTCTTCCTCCTCTTCCTTCTCGTCTCGTCTCTGGCCCTCGAGGCAGCCGCGGGGCGGGACGTCCCGACGGACGATGCCAAATTTTCCCACGACGGCACGGTGTGGGTCCCAGGCCTCGGCCGTTTCATGCTCCCCAAGAAAGGCTCCAAGTCCTTGGACTACAATCCCATCACCGGAGCCCCGGGAGGGAACGGCGTCTCCATCCCCGGGATCGGCGGCCGCAGCAATATCCCCGGCGGAGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790459.1
MASSSFFLLFLLVSSLALEAAAGRDVPTDDAKFSHDGTVWVPGLGRFMLPKKGSKSLDYNPITGAPGGNGVSIPGIGGRSNIPGGDDTFVPNPGTEVPVPSGGGIPTPSNP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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