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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000108`

染色体: Chr02 坐标: 1377569-1380305 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000108`
名称	SmilChr02G000108
描述	uncharacterized SmilChr02G000108
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1377569 - 1380305 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007568`
GeneID	`131007568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007568`
原始查询	`SmilChr02G000108`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=26.6; qcov=0.595; evalue=4.46e-23; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=24.4; qcov=0.255; evalue=2.21e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790460.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057790460.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057790460.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790460.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057790460.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1377645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B26,C14
`Chr2:1377657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C18
`Chr2:1377674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C15,C57
`Chr2:1377694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C18
`Chr2:1377702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C18
`Chr2:1377704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C18
`Chr2:1377713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C54
`Chr2:1377737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr2:1377739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,B97
`Chr2:1377754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B25
`Chr2:1377773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C35
`Chr2:1377774`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A25,B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790460.1

612 aa

306

612

DUF4283

PF14111 DUF4283 103-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790460.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	103	188	1.8e-06	28.3	Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934477.1
TTCATCACACACAACACTAGTGAAGATGGAAAACGGTGAAATCACAACAAGACGAGAAACTCAAAGCCGATGGATTCATACTAGCAGCAAGACCACCCTAAGGTGGAACTCACTTCGAGTATATATCACTCTTATAGCTTTCCTGACAACTAGAAACCGAGTAAAAATCCAACGTGATTAACTTTCCTTCGTAAGAGGATGGCAAGGAAACGAGAAACAGTCGAGCTTCAGCTAAAGCTACTTTCATCAATAAACTCTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007568
ATGAAACCCATTAATAAGTGTAGAATAAATGACAACATTCGGACAAATATTTTGTTGCATCATAGTTTCCAACGCACTCATCTTCCATATTTCCTTCCTTGCATAATGCTTTTGGAGTTAAGCCGGGGTGGAGATGTTCCATCCGGTACTCCTCCCGTGAAGTCGTTTGCCGAGTCTCTTAGGCAATCTTCGGGACGTCCCGCAGACGTCCCGGCTCATGAGTTTACGGTGCTGAAACCCGCAATGATGGACGACAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790460.1
MKPINKCRINDNIRTNILLHHSFQRTHLPYFLPCIMLLELSRGGDVPSGTPPVKSFAESLRQSSGRPADVPAHEFTVLKPAMMDDRPCLSISSAFRQRQIKSFQHAIHGRVFLRKGDSPRFAADLFTELSILWKTSSPPWQVIPLGKGYFTLKFSSPEDYALAFAKSAWRLRVGILFLQAWTPNFNPNKIVSSTAQVWVRIFNLPHEFWHPEVLSGIARHVGTPILVDGMSARASVGYFARVLVEMNVALDIPQFLDVKC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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