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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000116`

染色体: Chr02 坐标: 1471123-1473711 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000116`
名称	SmilChr02G000116
描述	uncharacterized SmilChr02G000116
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1471123 - 1473711 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007571`
GeneID	`131007571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007571`
原始查询	`SmilChr02G000116`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0142900` - identity=31.2; qcov=0.219; evalue=1.2e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790463.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057790463.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790463.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790463.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790463.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1471136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,C28,C34,C56,C7
`Chr2:1471144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,C28,C34,C56,C7
`Chr2:1471153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B37,B45
`Chr2:1471186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:1471224`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B13,B17,B31
`Chr2:1471224`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B13,B17,B31
`Chr2:1471233`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B120,B38,B39,B45,C59,C63,C84
`Chr2:1471247`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B35,C36
`Chr2:1471247`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B35,C36
`Chr2:1471279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:1471300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B107
`Chr2:1471361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790463.1

584 aa

292

584

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

PF17919 RT_RNaseH_2 405-461 aa PF17917 RT_RNaseH 453-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790463.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	405	461	4.2e-08	33.9	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057790463.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	453	488	1.9e-09	38.3	RNase H-like domain found in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934480.1
ATGAAAATATTTGGAAAGTTGGAGATTAATCTTCCATTCCTTCAAGAACTCAAATTTCCTCCACTGAGCAAGTTCCTGAAAGACTTTATTGCTGGTAAGTCTAAAGAATCTAGAAAAATCGTGATGGGCGAGAATGTGTCAGCCGTGATACAAAAGGAATTACCGCCCAAATGCAAGGATCCAGGTATGTTTTCTTTGCCATGTTTCATTGGTGATACAAAGATCGAGCATGCTATGTGTGACTTAGGAGCTTCTATTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007571
ATGAAAATATTTGGAAAGTTGGAGATTAATCTTCCATTCCTTCAAGAACTCAAATTTCCTCCACTGAGCAAGTTCCTGAAAGACTTTATTGCTGGTAAGTCTAAAGAATCTAGAAAAATCGTGATGGGCGAGAATGTGTCAGCCGTGATACAAAAGGAATTACCGCCCAAATGCAAGGATCCAGGTATGTTTTCTTTGCCATGTTTCATTGGTGATACAAAGATCGAGCATGCTATGTGTGACTTAGGAGCTTCTATTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790463.1
MKIFGKLEINLPFLQELKFPPLSKFLKDFIAGKSKESRKIVMGENVSAVIQKELPPKCKDPGMFSLPCFIGDTKIEHAMCDLGASINVMPLAVCDSLIGVELVDTRVVIQLVDRSCVHSEGLLENVLLRVHNFVYPADFYVVRMSGMQSKGTDDAMKTPNDAENAYAINVIDPLVQEFLETEFMQDKLELTLTKGWIYFDAQEMNDEEIKEAIMSLYAQSEIASSRSKLCLLKQTSYDRPLQSEKKPPVLELKPLPANLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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