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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000117`

染色体: Chr02 坐标: 1475662-1476780 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000117`
名称	SmilChr02G000117
描述	receptor-like protein 35
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1475662 - 1476780 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007572`
GeneID	`131007572`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007572`
原始查询	`SmilChr02G000117`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 35
产物	receptor-like protein 35
Arabidopsis	`AT3G24240` (AT3G24240) Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822011] identity=39.1; qcov=0.983; evalue=8.17e-43; confidence=medium
Rice	`Os10g0375000` (YK19) - identity=38.6; qcov=0.951; evalue=2.11e-45; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007572

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790464.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790464.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790464.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790464.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790464.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1475699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,D11
`Chr2:1475723`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A14,B102,B108,B110,B24,B6,B70,B83,B97,B98,C30,C36,C65,C83,C85,D1,D5
`Chr2:1475999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:1476069`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B75,C71
`Chr2:1476069`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B75,C71
`Chr2:1476324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B102,B126,C83
`Chr2:1476324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B126,C83
`Chr2:1476352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C27,C37
`Chr2:1476374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr2:1476462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B13
`Chr2:1476462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:1476606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790464.1

286 aa

143

286

LRR_1

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 7-28 aa PF23598 LRR_14 95-208 aa PF00560 LRR_1 105-127 aa PF13855 LRR_8 125-164 aa PF00560 LRR_1 129-151 aa PF00560 LRR_1 153-175 aa PF13516 LRR_6 175-196 aa PF00560 LRR_1 177-199 aa PF00560 LRR_1 226-247 aa PF00560 LRR_1 249-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790464.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	7	28	6.2e-27	88.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790464.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	95	208	1.7e-20	73.8	Leucine-rich repeat region
`XP_057790464.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	105	127	6.2e-27	88.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790464.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	125	164	1e-20	73.9	Leucine rich repeat
`XP_057790464.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	129	151	6.2e-27	88.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790464.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	153	175	6.2e-27	88.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790464.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	175	196	3.3e-06	27.4	Leucine Rich repeat
`XP_057790464.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	177	199	6.2e-27	88.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790464.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	226	247	6.2e-27	88.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057790464.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	249	267	6.2e-27	88.6	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934481.1
ATGGGGCTTTCACTTCCCAAACTCCAGCACCTCGCTTTATACTACAATAGACTCAACGGGAAAATTCCAAGCTCCATCAACAATGCTTCTATGCTCACTCTCTTGGAATTGAACAGAAACTCATTCACCGGCTCTGTGCCCGTCTTGAGCAATTTACGCTACTTGGAACACCTTCGCCTCTGGGAAAATAATTTCACAGGAGCAGAATTTATGTCATCTCTAACAAACTGCCCGTCTTTATTGTCCATAGAAATGTCGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007572
ATGGGGCTTTCACTTCCCAAACTCCAGCACCTCGCTTTATACTACAATAGACTCAACGGGAAAATTCCAAGCTCCATCAACAATGCTTCTATGCTCACTCTCTTGGAATTGAACAGAAACTCATTCACCGGCTCTGTGCCCGTCTTGAGCAATTTACGCTACTTGGAACACCTTCGCCTCTGGGAAAATAATTTCACAGGAGCAGAATTTATGTCATCTCTAACAAACTGCCCGTCTTTATTGTCCATAGAAATGTCGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790464.1
MGLSLPKLQHLALYYNRLNGKIPSSINNASMLTLLELNRNSFTGSVPVLSNLRYLEHLRLWENNFTGAEFMSSLTNCPSLLSIEMSYNPLMAGILPSSIGNFSKSLQIITASYCDFRGGIPSGIGNLSSLLYLQLSGNQFTGFIPTTIWNLTQLQKLYLGSNQLEGHISSDLCQLRNLRELNLSANSFTDPILECLGELQSLTSVSLALNKLNSTIPLSFWSLVDLVYLELQSNYLSGQISPQIGNLKSLDYLHLSSNQF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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