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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000120`

染色体: Chr02 坐标: 1603431-1604242 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000120`
名称	SmilChr02G000120
描述	putative cell wall protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1603431 - 1604242 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012536`
GeneID	`131012536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012536`
原始查询	`SmilChr02G000120`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative cell wall protein
产物	putative cell wall protein
Arabidopsis	`AT2G20870` (AT2G20870) cell wall protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816620] identity=45.8; qcov=0.637; evalue=2.21e-09; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29014 (Put_cell_wall)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057796502.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796502.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796502.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796502.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796502.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1603609`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C36
`Chr2:1603609`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C36
`Chr2:1603611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C19
`Chr2:1603630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr2:1603670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:1603688`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A8,B74
`Chr2:1603688`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A8,B74
`Chr2:1603690`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A25,B122,B20,B26,B37,B39,B59,B62,B97,C1,C77,D1,D2
`Chr2:1603706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:1603711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B97,C77,D1
`Chr2:1603759`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	B134,B2,B23,B34,B59,B65,B74,B81,B97,C67,C82,C84,D1,D2,D4
`Chr2:1603761`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	B134,B2,B23,B34,B59,B65,B74,B81,B97,C67,C82,C84,D1,D2,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796502.1

113 aa

113

Put_cell_wall

PF29014 Put_cell_wall 5-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796502.1`	Pfam	`PF29014`	Put_cell_wall	Family	5	112	1.4e-13	51.6	Putative cell wall protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940519.1
TAGAAGATATCAAAATTTAATATAAATGAAAGTAGTCAAGTACATGGACTCAAACTTTTACAGATGAAAGTAGAGAGATGATTTTTTTTAGAAAAAGGAAAAGAAATTGAATATGCATTTAACACTTTCACTCACTAAGAAAAAATGCATATAAACATTCTATGTAGCCTCAGTGAGTTCCATTAATCACCGCCAAAATTGTCACAAAATCTCACCTATAAAAACCCCTTCCAAATCCAATCTTCCATCATCACCAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012536
ATGGCATCCTCCGCCTTCTTCCTCCTCTTCCTCCTCGTCTCGTCTCTGGCCCTCGAGGCAGCCGCGGGGCGGGACGTCCCGACAGACGATGCCAAATTTTCCCACGACGGCACGGTGTGGGTCCCGGGCCTCGGCCGTTTCATGCTCCCCAAGAAAGGCTCCAAGTCCTTGGACTACAATCCCATCACCGGAGCCCCGGGAGGGAACGGCGTCTCCATCCCCGGGATCGGCGGCTCGACCGGCAGCCGCAGCTATATCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796502.1
MASSAFFLLFLLVSSLALEAAAGRDVPTDDAKFSHDGTVWVPGLGRFMLPKKGSKSLDYNPITGAPGGNGVSIPGIGGSTGSRSYIPGGDDTFAPGTEVPIPSGGGIPTPSSP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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