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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000121`

染色体: Chr02 坐标: 1631201-1635450 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000121`
名称	SmilChr02G000121
描述	probable protein phosphatase 2C 52
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1631201 - 1635450 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012538`
GeneID	`131012538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012538`
原始查询	`SmilChr02G000121`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 52
产物	probable protein phosphatase 2C 52
Arabidopsis	`AT4G03415` (PP2C52) Protein phosphatase 2C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827930] identity=72.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0566200` (OsPP2C64) - identity=61.4; qcov=0.903; evalue=8e-180; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057796503.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057796503.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057796503.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057796503.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796503.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1631463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:1631474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,C54
`Chr2:1631520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A5,B124,B98,C48
`Chr2:1631562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr2:1631601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr2:1631652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C24
`Chr2:1631667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:1631703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:1631709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:1632732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C28
`Chr2:1632792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C64
`Chr2:1633263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796503.1

473 aa

236

473

PP2C

PF00481 PP2C 93-348 aa

XP_057796504.1

473 aa

236

473

PP2C

PF00481 PP2C 93-348 aa

XP_057796505.1

473 aa

236

473

PP2C

PF00481 PP2C 93-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796503.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	93	348	1.5e-40	140.2	Protein phosphatase 2C
`XP_057796504.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	93	348	1.5e-40	140.2	Protein phosphatase 2C
`XP_057796505.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	93	348	1.5e-40	140.2	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940520.1
AGAAGATATGTCCATGTCTACCATCATCATTTTAGCCGGGCACTTTGCTCTTTCAAATCCACCCCTTCTCATTATCTCTCTCGCCAACCCTTTCTCCCTCTCTCTCTCACTCACACACACACACACTTTTCATGCAATTGCAATTAATGCACCATCTTCACCCCCCAACAACAATCTTTCTGCTCCACTGCTTTTACCCCTCCTGCTAAATTTAAAGAACTCACATTTGCTTCATGCAGCAAAACTCGACCTTCAATCTC...

XM_057940521.1
TGTCCATGTCTACCATCATCATTTTAGCCGGGCACTTTGCTCTTTCAAATCCACCCCTTCTCATTATCTCTCTCGCCAACCCTTTCTCCCTCTCTCTCTCACTCACACACACACACACTTTTCATGCAATTGCAATTAATGCACCATCTTCACCCCCCAACAACAATCTTTCTGCTCCACTGCTTTTACCCCTCCTGCTAAATTTAAAGAACTCACATTTGCTTCATGCAGCAAAACTCGACCTTCAATCTCCCCGCCTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131012538
ATGGGGGGTTGTGTCTCGATTAGTAGTCAGAGCACTTGTAGTAGCAGGAGTAATGGAGAGAGGATATCTCCTTCATGTTTGTGGATAGATATGTTTCGGCGCAAGAGAAGTAGGAGGACCTTTTCCGACCATGCCACCACTTTGCAACATCTCTCCTCTGTCCCTAACAGGATAATCACCAACGGGAGGAGCAGCAGTTCTTGCATATTCACTCAGCAAGGCCGGAAAGGCATAAACCAGGACGCTATGATTGTGTGGGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057796503.1
MGGCVSISSQSTCSSRSNGERISPSCLWIDMFRRKRSRRTFSDHATTLQHLSSVPNRIITNGRSSSSCIFTQQGRKGINQDAMIVWEDFMAEDVTFCGVFDGHGPHGHLVARKVRDTLPLKLSSFMNSSESKKNGSSANCCNGNVKSDVVDPVKDTPVEDRVESSWREAFLKAYKSMDKELRSHPNLDCFCSGSTAVSVIKQGQNLFIGNIGDSRAILGSKDSNDSMVAIQLTVDLKPDLPKEAERIKRCKGRVFALQDE...

XP_057796504.1
MGGCVSISSQSTCSSRSNGERISPSCLWIDMFRRKRSRRTFSDHATTLQHLSSVPNRIITNGRSSSSCIFTQQGRKGINQDAMIVWEDFMAEDVTFCGVFDGHGPHGHLVARKVRDTLPLKLSSFMNSSESKKNGSSANCCNGNVKSDVVDPVKDTPVEDRVESSWREAFLKAYKSMDKELRSHPNLDCFCSGSTAVSVIKQGQNLFIGNIGDSRAILGSKDSNDSMVAIQLTVDLKPDLPKEAERIKRCKGRVFALQDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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