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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000125`

染色体: Chr02 坐标: 1705286-1708522 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000125`
名称	SmilChr02G000125
描述	uncharacterized SmilChr02G000125
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1705286 - 1708522 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012543`
GeneID	`131012543`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012543`
原始查询	`SmilChr02G000125`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT4G03420; symbol=AT4G03420; hit=AT4G03420; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AT4G03420; symbol=AT4G03420; hit=AT4G03420; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G03420` (AT4G03420) - identity=68.7; qcov=0.997; evalue=2.77e-146; confidence=high
Rice	`Os10g0494000` (OSJNBa0041P03.5) - identity=49.2; qcov=0.987; evalue=4e-101; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05623 (DUF789)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012543

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057796508.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796508.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057796508.1`
4	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.20000	`XP_057796508.1`
5	Autophagosome	Autophagosome	0.20000	`XP_057796508.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1706412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B37
`Chr2:1706675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr2:1706992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr2:1707070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:1707163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C41,D11
`Chr2:1707187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:1707611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B59,B96
`Chr2:1707915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,C16,C35,C76
`Chr2:1707981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796508.1

317 aa

158

317

DUF789

PF05623 DUF789 12-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796508.1`	Pfam	`PF05623`	DUF789	Family	12	311	1e-110	370.8	Protein of unknown function (DUF789)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940525.1
TCAGTGGAGAAAGATAATGCCATAAAATGAGAAGAAAAGAAAAATCTCTTACTTCTGTTTCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAACACACGCATTCAGGCACCTGCTTTACCAGTGGTGACCAAAATTCTGGTTTTCAAACTCGAATTACATCACTTGGGTTTGGCTTTTTAAAGAAAAGTTGATTCCCTTTTTTATCACAAAAGAGAAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012543
ATGTTGATCTTCGACAAGGTTTCAATGCAGACAACAAACCTCGAAAGCTTCTTGGATTGCACAACGCCCCTCGCCCCATCTCAGTTCCTCCCCAAGAGTGAGACAAGGAAGCTTAATAGGCTGTGGCATCCATGGGAAAGGGAAAAAGTTGACTATTTTGTTCTTGCTGATCTTTGGAATAGCTTTGATGAATGGAGTGCTTACGGCGCCGGAGTTCCGATCGTCTCCGACGACGGCCAAAATCTCATCCAATACTTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796508.1
MLIFDKVSMQTTNLESFLDCTTPLAPSQFLPKSETRKLNRLWHPWEREKVDYFVLADLWNSFDEWSAYGAGVPIVSDDGQNLIQYFVPYLSAIQIFTSTSSANCLREESDSVSETRDSFSDSFSDESESEKLSRWDGCSSEEGICEQDLWHQNERLGNLYLQYFERSSPYGRVPLTDKISSLAQRHPGLMSLRSVDLSPASWMAVAWYPIYHIPTGRTIRDLQTCFLTYHTLSSSFQDMDLGDDDENLKRKRKEGESIPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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