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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000132`

染色体: Chr02 坐标: 1810731-1822372 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000132`
名称	SmilChr02G000132
描述	dihydroorotase, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1810731 - 1822372 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012552`
GeneID	`131012552`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012552`
原始查询	`SmilChr02G000132`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dihydroorotase, mitochondrial-like
产物	dihydroorotase%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G22930` (PYR4) pyrimidin 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828392] identity=73.3; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0747500` (PYRC) - identity=70.9; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004151 (dihydroorotase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006207 ('de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process); GO:0006221 (pyrimidine nucleotide biosynthetic process); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01979 (Amidohydro_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012552

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796522.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796522.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796522.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796522.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796522.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1811697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C55
`Chr2:1812211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:1812217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr2:1813177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:1814049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796522.1

389 aa

194

389

Amidohydro_1

PF01979 Amidohydro_1 53-354 aa

XP_057796523.1

389 aa

194

389

Amidohydro_1

PF01979 Amidohydro_1 53-354 aa

XP_057796524.1

389 aa

194

389

Amidohydro_1

PF01979 Amidohydro_1 53-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796522.1`	Pfam	`PF01979`	Amidohydro_1	Domain	53	354	1.7e-23	84.2	Amidohydrolase family
`XP_057796523.1`	Pfam	`PF01979`	Amidohydro_1	Domain	53	354	1.7e-23	84.2	Amidohydrolase family
`XP_057796524.1`	Pfam	`PF01979`	Amidohydro_1	Domain	53	354	1.7e-23	84.2	Amidohydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

13 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097371.1
AAAAAAATAACTATGTTAAATAGGACGAACGAAGGGAGTAGTAGATCACTCACCCTCCCATTCTCATCTCCCTCTCTGCGTCTGACTCTTGCTCTAATCCTCCATCTCATTATAGTCGCAGATACTAGAAAAAGGCATTTAGAGCTGTTATCTTGTTTGTAGGATGTTGAAGACATCTCTGGGTCCTTACAGAGGAAGTGCTCTTGCTGTGCCTTCAGAGTTCTCTGTCAAGTTGTCATCTGCACTTGTGAGAGCTACAA...

XR_009097375.1
AAAAAAATAACTATGTTAAATAGGACGAACGAAGGGAGTAGTAGATCACTCACCCTCCCATTCTCATCTCCCTCTCTGCGTCTGACTCTTGCTCTAATCCTCCATCTCATTATAGTCGCAGATACTAGAAAAAGGCATTTAGAGCTGTTATCTTGTTTGTAGGATGTTGAAGACATCTCTGGGTCCTTACAGAGGAAGTGCTCTTGCTGTGCCTTCAGAGTTCTCTGTCAAGTTGTCATCTGCACTTGTGAGAGCTACAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131012552
ATGTTGAAGACATCTCTGGGTCCTTACAGAGGAAGTGCTCTTGCTGTGCCTTCAGAGTTCTCTGTCAAGTTGTCATCTGCACTTGTGAGAGCTACAAGACCAATCCATCTGAAAGCATTCGGGGTAAGAATGGAGCTTTTGATCACACAACCTGATGACTGGCATCTCCATCTTCGTGATGGGGAGCTTCTTGAAGCAGTTGCCCCCCACAGTTCACAACACTTTGGGAGAGCCATAGTCATGCCGAATCTGAGACCTCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057796522.1
MLKTSLGPYRGSALAVPSEFSVKLSSALVRATRPIHLKAFGVRMELLITQPDDWHLHLRDGELLEAVAPHSSQHFGRAIVMPNLRPPVTTTAAAIAYRQSILNALPKDSDFTPLMTLYLTDTTSPDEIKLARESGVVYAVKLYPAGATTNSQDGVTDLFGKCLPVLEEMVQQNMPLLVHGEVTSADVDVFDREKVFIDTVLVPLIQKLPRLKVVMEHITTKDAVDFVLSSDERFVAATVTPQHIVLNRNSLFQGGLQPHN...

XP_057796523.1
MLKTSLGPYRGSALAVPSEFSVKLSSALVRATRPIHLKAFGVRMELLITQPDDWHLHLRDGELLEAVAPHSSQHFGRAIVMPNLRPPVTTTAAAIAYRQSILNALPKDSDFTPLMTLYLTDTTSPDEIKLARESGVVYAVKLYPAGATTNSQDGVTDLFGKCLPVLEEMVQQNMPLLVHGEVTSADVDVFDREKVFIDTVLVPLIQKLPRLKVVMEHITTKDAVDFVLSSDERFVAATVTPQHIVLNRNSLFQGGLQPHN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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