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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000133`

染色体: Chr02 坐标: 1825850-1836169 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000133`
名称	SmilChr02G000133
描述	homeobox-leucine zipper protein PROTODERMAL FACTOR 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1825850 - 1836169 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012549`
GeneID	`131012549`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012549`
原始查询	`SmilChr02G000133`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein PROTODERMAL FACTOR 2-like
产物	homeobox-leucine zipper protein PROTODERMAL FACTOR 2-like
Arabidopsis	`AT4G04890` (PDF2) protodermal factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825828] identity=51.8; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0187500` (Roc1(t)) - identity=52.8; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF01852 (START); PF25797 (PDF2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012549

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796519.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796519.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796519.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796519.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1827318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C42
`Chr2:1827522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B51,C27,C28,C3,D1
`Chr2:1827531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B73
`Chr2:1827604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:1827622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:1827635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr2:1827651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C71
`Chr2:1827669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B15,B26,C5,C55
`Chr2:1827705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C28,C82
`Chr2:1829639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:1829696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:1829761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796519.1

638 aa

319

638

Homeodomain

START

PDF2_C

PF00046 Homeodomain 22-77 aa PF01852 START 166-384 aa PF25797 PDF2_C 400-636 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796519.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	22	77	6.5e-17	61.8	Homeodomain
`XP_057796519.1`	Pfam	`PF01852`	START	Domain	166	384	1e-46	159.6	START domain
`XP_057796519.1`	Pfam	`PF25797`	PDF2_C	Domain	400	636	4.8e-75	252.5	PDF2-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940536.1
TCTTACAACACGAGCTTTATTATAAAGCCAACAAATTAAAGTTTATTGAACTTGAGACACATATTCTAAAATTGATCCTATTTAGGAAGTCGTGTCATAGGTTGGCATCTAACGGTCTAAGACTACATCCACTAATATATAATAATTACATTCCTTTTTATTTTTCACGAATCGATTTGGGAAAAAATGGGTGATGAGAGAGAAGCTCTTAAAGGAAAGATGAGTGATGAGAGAGAAGCTTTGAGCAACAGAAAACGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012549
ATGGGTGATGAGAGAGAAGCTCTTAAAGGAAAGATGAGTGATGAGAGAGAAGCTTTGAGCAACAGAAAACGCTACCATCGTCACTCTCAACAACAGATCCAACAAATGGAAGCGTTTTATAAAGAATGTCCACATCCGGACGAGAAGCAAAGAAAAGAACTGAGTATTCAACTTGGGATAGAACCAATTCAAGTCAAATTTTGGTTCCAAAACAAGAGAACACAAATGAAGACGCAGCACGAGCACAACGAGAACGCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796519.1
MGDEREALKGKMSDEREALSNRKRYHRHSQQQIQQMEAFYKECPHPDEKQRKELSIQLGIEPIQVKFWFQNKRTQMKTQHEHNENAQLRIENERLRAENLRFREALINISCPNCGVPNFQESQLMENYSLNQHASKPSSWAPHLAIGPINNEVESEDYRAAVMEAASSAMEELVRVAQLGEPLWVASADRHTFVLNEEEYFRAFPKVFGPRRDGFKSEASREAIVVPATAADVVGILMDVEQWTNVFSGVVSQATNLQVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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