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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000135`

染色体: Chr02 坐标: 1846072-1849597 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000135`
名称	SmilChr02G000135
描述	uncharacterized SmilChr02G000135
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	1846072 - 1849597 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012551`
GeneID	`131012551`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012551`
原始查询	`SmilChr02G000135`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ist1p [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28718274]; symbol=AT2G14830; hit=AT2G14830; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ist1p [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28718274]; symbol=AT2G14830; hit=AT2G14830; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G14830` (AT2G14830) Ist1p [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28718274] identity=49.5; qcov=0.423; evalue=2.23e-57; confidence=low
Rice	`Os08g0175200` - identity=41.2; qcov=0.349; evalue=3.08e-36; confidence=low
GO	GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF03398 (Ist1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012551

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057796521.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057796521.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796521.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057796521.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796521.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:1846521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:1846706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:1846739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:1846778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C22
`Chr2:1847356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B66,D9
`Chr2:1847358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:1848050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B46,C71
`Chr2:1848105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A5,B124,B98,C48
`Chr2:1848114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B13,C28,C82
`Chr2:1848134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B29,B93,C71
`Chr2:1848337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B66,D11,D9
`Chr2:1848435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796521.1

459 aa

230

459

Ist1

PF03398 Ist1 15-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796521.1`	Pfam	`PF03398`	Ist1	Family	15	174	1.7e-46	158.9	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940538.1
GCTCAACTATTCTTTGACTCCTATCTTCTTATTTTAGTTTTAGTTTTCGACCTATAGAGAGAGAGAAGTAATTCGTAGTGGAGTTAGTTTCCATAGAGTGGTGAAGCACGCTATTCTTTTCTCTGTCATCTATTTCTTAATATTTTTATCTAAATATTTATTTATATATTCAATCTCTCTCTCTCCTGCACCCCACCCCACCCACTCCCCTCCTAAAAATAACTGCCGGGAAAATGTAAAACCCTCAACTCCCATTGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012551
ATGTTTAATATTCTGTTTGGATGGACAAAGGCTTCGAAATGTAAGAAACTGATAAAGAGGGTGCAGTGTCGGCTGAAACTGCTCAAGAGCAAGAGGAGTTGCATTGTGAAGCAGCTGAGAAACGACGTCGCCGAGCTTCTCAAGCACGGCCACGATCAAGCCGCTTTCGATAGGGTAGAGCAAGTTGTGATTGATGAAAATATGGTTCAAGTATATGATCTGCTGTACCAGTTTTGTGAATTTATAATCATTAATCTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796521.1
MFNILFGWTKASKCKKLIKRVQCRLKLLKSKRSCIVKQLRNDVAELLKHGHDQAAFDRVEQVVIDENMVQVYDLLYQFCEFIIINLPYIRKHRDCPNDINEAASTLIFSSARFGELPELLSLRKLFGGRYGQKFVTAAIELLPGNLVSTQIIENLDMKSVPDNVKYKFLDEISRSCIEAGPLFLEYKPHLQENEMCDQNDIVRGDRERDGKIMYEDLLKINEENKFWKKSCFGLRKEVDFGNHEMETSSENSAKLGEEVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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