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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000158`

染色体: Chr02 坐标: 2040942-2043017 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000158`
名称	SmilChr02G000158
描述	clathrin light chain 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2040942 - 2043017 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012573`
GeneID	`131012573`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012573`
原始查询	`SmilChr02G000158`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clathrin light chain 1-like
产物	clathrin light chain 1-like
Arabidopsis	`AT2G20760` (AT2G20760) Clathrin light chain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816605] identity=51.6; qcov=0.833; evalue=6.73e-69; confidence=high
Rice	`Os04g0679100` - identity=69.2; qcov=0.479; evalue=1.2e-55; confidence=medium
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0030130 (clathrin coat of trans-Golgi network vesicle); GO:0030132 (clathrin coat of coated pit); GO:0032050 (clathrin heavy chain binding); GO:0048268 (clathrin coat assembly); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF01086 (Clathrin_lg_ch)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012573

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796538.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796538.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057796538.1`
4	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057796538.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796538.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2041129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B88
`Chr2:2041340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:2042389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B71,C6
`Chr2:2042420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B32,C39
`Chr2:2042575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:2042590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B23,B3,B30,C33
`Chr2:2042634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr2:2042638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:2042677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B122
`Chr2:2042678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B3,B30
`Chr2:2042686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr2:2042695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796538.1

305 aa

152

305

Clathrin_lg_ch

PF01086 Clathrin_lg_ch 97-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796538.1`	Pfam	`PF01086`	Clathrin_lg_ch	Family	97	201	5.3e-05	24.0	Clathrin light chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940555.1
AACAGCTGAAATGCACCGCTTTCTTCTCCAAATCTCATCACACACACATTGACACACACCACTATACATACACATCTACATACACGAATCAGGTTTCGGGAAAAAATGGAAGGATTTGACGAAGATGTCTACGTCGGACGAAACGACGCCGGGGACGAGAACGCCATGCACTACGGCTACGACGGCGGCGCGCCACCGCCGCCGCCGCCGATGGACGGATTATCCCGAAACGACGGCATGCAGGGATACGACTTCGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012573
ATGGAAGGATTTGACGAAGATGTCTACGTCGGACGAAACGACGCCGGGGACGAGAACGCCATGCACTACGGCTACGACGGCGGCGCGCCACCGCCGCCGCCGCCGATGGACGGATTATCCCGAAACGACGGCATGCAGGGATACGACTTCGGCGGCGGCGGCGGCGCACCACCAACACCGCCGCCGATCGAGGGATACGGGCAGGGGAAGCCGTACGACCTCTCGGCGGACAGCGAGGGCATCTTCGCGGCGGCGGACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796538.1
MEGFDEDVYVGRNDAGDENAMHYGYDGGAPPPPPPMDGLSRNDGMQGYDFGGGGGAPPTPPPIEGYGQGKPYDLSADSEGIFAAADSGGPLLPDPSEMREQGSAFREWRRQNMIYLEEKEKKEKELRNQIIAEADEWKRKFYEKRNQNCETNKTHNREREKIYYAQQEKFHKEADNQFWKAIAEIIPREVPNLEKRRGKKDDEKKPAVFVVQGPKPGKPTDMARMRQILAKLKTNPPLHMRPPPPKEEGKEGKPEAKKNN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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