当前解析结果
SmilChr02G000159| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000159 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000159 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000159 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 2061494 - 2062016 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007595 |
|---|---|
| GeneID | 131007595 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007595 |
| 原始查询 | SmilChr02G000159 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007595 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057790484.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057790484.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057790484.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790484.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790484.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:2061495 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A15,C37 |
Chr2:2061520 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C16,C3,C53 |
Chr2:2061594 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,C35,C42,D6 |
Chr2:2061599 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,B102 |
Chr2:2061600 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B109,C10 |
Chr2:2061618 |
ATC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B3,C61 |
Chr2:2061618 |
ATC |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B3,C61 |
Chr2:2061620 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,A8,C83 |
Chr2:2061622 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B92,C43,C49,C86,D10 |
Chr2:2061629 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B27,B51,C1 |
Chr2:2061629 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B27,B51,C1 |
Chr2:2061630 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 8 | A1,B14,B17,B63,C31,C32,C33,C39 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。