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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000168`

染色体: Chr02 坐标: 2173683-2177646 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000168`
名称	SmilChr02G000168
描述	switch 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2173683 - 2177646 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012582`
GeneID	`131012582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012582`
原始查询	`SmilChr02G000168`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	switch 2-like
产物	switch 2-like
Arabidopsis	`AT1G03750` (SWI2) switch 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839417] identity=65.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0247900` (CSB) - identity=61.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0140658 (ATP-dependent chromatin remodeler activity)
KEGG	-
Pfam	PF00176 (SNF2-rel_dom); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796548.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796548.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796548.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796548.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2173959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B48,C16,C55,D2
`Chr2:2174814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:2174897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C39
`Chr2:2174998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr2:2175752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B33,C41,C85
`Chr2:2175791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr2:2175823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B20,C28,C61
`Chr2:2176604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B111,B84,C52,C76
`Chr2:2176948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr2:2176952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:2176960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B113,B28,C58,C9
`Chr2:2176985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796548.1

861 aa

430

861

ResIII

SNF2-rel_dom

Helicase_C

PF04851 ResIII 138-307 aa PF00176 SNF2-rel_dom 139-414 aa PF00271 Helicase_C 532-644 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796548.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	138	307	2.2e-07	31.6	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057796548.1`	Pfam	`PF00176`	SNF2-rel_dom	Domain	139	414	2.2e-65	221.4	SNF2-related domain
`XP_057796548.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	532	644	1.7e-26	93.3	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940565.1
ACGAAGCTTTTGAAAGAGTCGATGGCGGTTCCACCGAATAAACATGCACTGAAATCGTGAAAAAGTAACTCCCAAAAATTCAGCAATTCCAATTTCCATGTCATTGAACGCTTTCAAGGAGGCGCTCAAGCCCTGCAAATCCACTATAACGCCGTCCCAATCATCTCCATCTTCTTCGCGAATTTCTCTAGGTTTTGACCCCTCAATTCCACTCAGAAAGCCCCCCAAATCCTCGCTGTCTCGCCAACTTCTCCGCCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012582
ATGTCATTGAACGCTTTCAAGGAGGCGCTCAAGCCCTGCAAATCCACTATAACGCCGTCCCAATCATCTCCATCTTCTTCGCGAATTTCTCTAGGTTTTGACCCCTCAATTCCACTCAGAAAGCCCCCCAAATCCTCGCTGTCTCGCCAACTTCTCCGCCTCCACGATGCTGCCGATTTCTCGCCGCCAAACGAACTCAAAATATCGAAACCGGAGCCCAATTCGAGCGCCGGAGGCAGAAATGATAAATGCGAGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796548.1
MSLNAFKEALKPCKSTITPSQSSPSSSRISLGFDPSIPLRKPPKSSLSRQLLRLHDAADFSPPNELKISKPEPNSSAGGRNDKCEEEEKEAEIRPRAIKVESFRSFDHSGPYEPLLLSLPGEIPVVQVPASINSRLLEHQRVGVKFLYNLYKNNHGGILGDDMGLGKTIQTIAFLAAVFGKGSDESDTVLTSHNGNRVEKKGPVLIICPSSVILNWESEFSKWSTFSVAVYHGVNRDLVIDKLKADDVEIIITSFDTYRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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