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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000172`

染色体: Chr02 坐标: 2198951-2210748 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000172`
名称	SmilChr02G000172
描述	two pore calcium channel protein 1A-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2198951 - 2210748 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012587`
GeneID	`131012587`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012587`
原始查询	`SmilChr02G000172`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two pore calcium channel protein 1A-like
产物	two pore calcium channel protein 1A-like
Arabidopsis	`AT4G03560` (TPC1) two-pore channel 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825655] identity=66.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0678500` (TPC1) - identity=61.1; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000325 (plant-type vacuole); GO:0005245 (voltage-gated calcium channel activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0006816 (calcium ion transport); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00520 (Ion_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012587

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057796553.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057796553.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796553.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796553.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796553.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2201256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:2201295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr2:2204712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796553.1

729 aa

364

729

Ion_trans

PF00520 Ion_trans 122-311 aa PF00520 Ion_trans 434-678 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796553.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	122	311	1.3e-62	211.9	Ion transport protein
`XP_057796553.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	434	678	1.3e-62	211.9	Ion transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940570.1
CTGCTTCACTAGCCAATGCCGACAGATTCTCGCGACACGTTGCTTCTCTCTCATTCTACTTTACCTATTGGAAGCTAAAACTTGGTCCCCCGACAAATTTTCAATTCACATATATGAATGTATAACTAACAACAACCAATTTCGCTTTCGACCCATAAATCAGCTTACTGAAGCTGTACTGTGCGCCACCTGTTTGATAAACGGTCACACAAAGGGACAAACAAAGTGGGTTTACTCAGTGAAGAAAGCCCACATCTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012587
ATGGATGAATCTCTTCTCGGTGATGGAGGCGACAGTGGCGGCCCAAGGCGGGATCGTCGGCGCTTGTTTGATCGAAGATCGGAAGCTATCGCTCATGGCTCGACCTATGAAAAGGCTGCTGCTTTGGTTGATCTTGCGGAAGATGGAATCGGGATACCTGAGGAAATATTTGACCAGCCAAGTTTTGGAAGCTCCTTAAAGTCATATCTGGTGTTTATAAAATTTGATTTCCTTTGGAGCCTGAACTACTTTGCTCTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796553.1
MDESLLGDGGDSGGPRRDRRRLFDRRSEAIAHGSTYEKAAALVDLAEDGIGIPEEIFDQPSFGSSLKSYLVFIKFDFLWSLNYFALLLLNFLEKPLWCKEECNDRKYYYLGQLPYLTGTESLIYEVITLVILTVHTIFPITYEGLSIYWNCLVNRLKVVLLLLLVIDLVVFIIFLSPVGFYTLPFRLAPYLRVAFFILAIRELRDTLVILFGMLLTYLNVLALLLLFLLFSSWLAYVIFEDTDQGKTTFTSYGATVYQMF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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