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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000178`

染色体: Chr02 坐标: 2272344-2285877 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000178`
名称	SmilChr02G000178
描述	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2272344 - 2285877 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012591`
GeneID	`131012591`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012591`
原始查询	`SmilChr02G000178`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
产物	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT3G29670` (PMAT2) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822645] identity=35.5; qcov=0.959; evalue=4.08e-74; confidence=medium
Rice	`Os02g0820400` - identity=33.9; qcov=0.952; evalue=9.05e-64; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012591

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796557.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796557.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057796557.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796557.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796557.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2272362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B137
`Chr2:2272366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B137
`Chr2:2272394`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A10,A13,A3,B111,B121,B122,B133,B15,B17,B18,B20,B21,B25,B26,B32,B36,B4,B51,B52,B53,B62,B73,B85,B87,B9,B97,C13,C14,C17,C22,C27,C29,C3,C34,C38,C42,C46,C47,C57,C64,C66,C70,C71
`Chr2:2272428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C32,C68
`Chr2:2272532`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A1,A14,A18,A19,A3,A6,A9,B10,B100,B102,B105,B106,B107,B108,B109,B12,B128,B130,B135,B138,B14,B16,B19,B20,B22,B23,B24,B27,B29,B31,B34,B46,B47,B49,B5,B54,B59,B60,B62,B65,B70,B71,B72,B75,B77,B79,B81,B88,B95,C14,C15,C19,C20,C23,C30,C32,C33,C35,C36,C39,C40,C43,C45,C49,C50,C54,C56,C58,C61,C65,C7,C71,C72,C73,C76,C81,C9,D1,D11,D2,D4,D5,D6,D8
`Chr2:2272561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B17,B39,B4
`Chr2:2272562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr2:2272578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C85
`Chr2:2272606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:2272607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B135,D10,D2
`Chr2:2272629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,C15,C2,C9
`Chr2:2272635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796557.1

459 aa

230

459

Transferase

PF02458 Transferase 52-452 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796557.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	52	452	4.6e-42	144.9	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940574.1
AGCTCCAATTAATGGCGACCAAGCTCCAAAACTGCAAAATTTACCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCAGCAGCAGCAATCAAGAATTCTACACCCCATTAACACACTTCGACATTCCATTCCTACAATCTGATCCCACAAAGAGACTCATCTTCTTCGAATTCCCCTGCTCAGACCTCCATTTCCATGAACACATCCTTCCATCGCTGAAAAATTCTCTCTCCCTCACTCTCGCACACTTCCTCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012591
ATGGCGACCAAGCTCCAAAACTGCAAAATTTACCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCAGCAGCAGCAATCAAGAATTCTACACCCCATTAACACACTTCGACATTCCATTCCTACAATCTGATCCCACAAAGAGACTCATCTTCTTCGAATTCCCCTGCTCAGACCTCCATTTCCATGAACACATCCTTCCATCGCTGAAAAATTCTCTCTCCCTCACTCTCGCACACTTCCTCCCCCTCGCCGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796557.1
MATKLQNCKIYPSSSSSSSSSSSSSSNQEFYTPLTHFDIPFLQSDPTKRLIFFEFPCSDLHFHEHILPSLKNSLSLTLAHFLPLAGNVVLPSNSGSPVIRYVSGDSVSLTAAQSDQDFHYLASHHQRLANHFYELIPELPPAARRPDSSVVFPAAAIQITQFAGQGICIGITNHHAVADESSTVNFVKSWGCANRFGDTEAFHQTLATHFPLFDRTLVEDPKRLDSIALEFIRNRNLPIEQPSSVEFSTNRIRSTFLLTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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