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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000179`

染色体: Chr02 坐标: 2286895-2288286 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000179`
名称	SmilChr02G000179
描述	phenolic glucoside malonyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2286895 - 2288286 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007599`
GeneID	`131007599`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007599`
原始查询	`SmilChr02G000179`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phenolic glucoside malonyltransferase 1-like
产物	phenolic glucoside malonyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT3G29670` (PMAT2) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822645] identity=35.1; qcov=0.985; evalue=3e-77; confidence=medium
Rice	`Os02g0820400` - identity=31.8; qcov=0.95; evalue=9.14e-50; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007599

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790488.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790488.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790488.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790488.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790488.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2287384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B103,C14
`Chr2:2287394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:2287395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B103,C14
`Chr2:2287405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B103,C14
`Chr2:2287409`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A13,B103,C14
`Chr2:2287409`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A13,B103,C14
`Chr2:2287437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B103,C14,C31,C34
`Chr2:2287477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A13,B103,C14,C31,C34,C60,C64
`Chr2:2287483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B103,C31,C34,C60
`Chr2:2287700`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A14,A16,A19,B106,B109,B138,B16,B29,B47,B48,B55,B59,B61,B65,B75,C15,C23,C30,C39,C43,C50,C54,C56,C58,C61,C65,C7,C8,C9,D1,D6
`Chr2:2287755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B17,B30
`Chr2:2287761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790488.1

463 aa

232

463

Transferase

PF02458 Transferase 21-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790488.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	21	437	2.4e-49	168.9	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934505.1
ATGGCGATCAAGCTCGAAAACTGCCGAATTTACCCTTCTTCTTCAAGACAATTCTGCACCCCATTAACACACTTCGACATTCCATTCCTACAATCTGATCCCACAAAGAGACTCATCTTCTTCGATCTCCCCTGCTCAGACCTCTATTTCCATGAACACATCCTTCCATCGCTGAAAAATTCTCTCTCCCTCACTCTCGCACACTTCCTCCCCCTCGCCGGAAACGTAGTCCTCCTGTTAAACTCCGGCAGCCCCATGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007599
ATGGCGATCAAGCTCGAAAACTGCCGAATTTACCCTTCTTCTTCAAGACAATTCTGCACCCCATTAACACACTTCGACATTCCATTCCTACAATCTGATCCCACAAAGAGACTCATCTTCTTCGATCTCCCCTGCTCAGACCTCTATTTCCATGAACACATCCTTCCATCGCTGAAAAATTCTCTCTCCCTCACTCTCGCACACTTCCTCCCCCTCGCCGGAAACGTAGTCCTCCTGTTAAACTCCGGCAGCCCCATGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790488.1
MAIKLENCRIYPSSSRQFCTPLTHFDIPFLQSDPTKRLIFFDLPCSDLYFHEHILPSLKNSLSLTLAHFLPLAGNVVLLLNSGSPMIRCVAGDSVSLIAAQSDQDLHYLASHHQRVADHFYECVPELPLATRCADFVVFPVVALQITLFAGQGICIGITNHHAVADGSSIVNFVKSWGCANRSRDAEEHLPVFDRALVEDPEKLDSIAWKFVKNRNPHLDISPSVVEFPINRIRSTLLLTKNQIEILKNHVYAKTPNLGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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