当前解析结果
SmilChr02G000183| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000183 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000183 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000183 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 2321516 - 2326040 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007825 |
|---|---|
| GeneID | 131007825 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007825 |
| 原始查询 | SmilChr02G000183 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007825 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790723.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057790723.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790723.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790723.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790723.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:2321559 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B102,B129,B55,B57,B72,C13 |
Chr2:2321616 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 25 | A2,A25,B11,B110,B136,B137,B140,B15,B2,B31,B38,B39,B60,B84,B85,B91,C11,C12,C26,C29,C30,C55,C59,C69,C84 |
Chr2:2321621 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,D8 |
Chr2:2321638 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B45,B88,C14,C72,C74 |
Chr2:2321639 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B51 |
Chr2:2321639 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B51 |
Chr2:2321670 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B77,C36,D8 |
Chr2:2321691 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,D8 |
Chr2:2325038 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr2:2325784 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。