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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000190`

染色体: Chr02 坐标: 2366670-2368286 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000190`
名称	SmilChr02G000190
描述	anthocyanidin 3-O-glucoside 6''-O-acyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2366670 - 2368286 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012594`
GeneID	`131012594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012594`
原始查询	`SmilChr02G000190`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	anthocyanidin 3-O-glucoside 6''-O-acyltransferase-like
产物	anthocyanidin 3-O-glucoside 6''-O-acyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G03940` (AT1G03940) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839366] identity=34; qcov=1.03; evalue=2.06e-80; confidence=low
Rice	`Os02g0820400` - identity=32; qcov=1.03; evalue=1.07e-66; confidence=low
GO	-
KEGG	smil00942 (Anthocyanin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796560.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796560.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796560.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796560.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796560.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2366905`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B3,C3,C38
`Chr2:2366905`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B3,C3,C38
`Chr2:2367030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr2:2367041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:2367049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:2367052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:2367076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B135,C16,C39
`Chr2:2367138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr2:2367192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B52,C14,C27,D10
`Chr2:2367267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:2367278`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B138,B48,B55,B61,C23,C54,C58,C7,C9
`Chr2:2367309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796560.1

454 aa

227

454

Transferase

PF02458 Transferase 10-445 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796560.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	10	445	2.5e-41	142.5	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940577.1
TTATTTATATACAGTAAATCTTGTCCAGAAATATTCAGAAAAACCTGACCCCACAAATCTAGCCCTCCGCCGATGACGACGGCCCTGCTTGAAACCTCCCAAATCGCTCCGCCGCCGGAAGCGGCAGCCGAGCAGTCGCTGCCGCTGACCTTCATGGACATCGATTGGCTGATTTTCCACCCAATCCGTCGCCTCATCTTCTACGAATTCCCTTGCTCGAAGCCTCATTTCTTAGAAGTAATCGTCCCCAAACTCAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012594
ATGACGACGGCCCTGCTTGAAACCTCCCAAATCGCTCCGCCGCCGGAAGCGGCAGCCGAGCAGTCGCTGCCGCTGACCTTCATGGACATCGATTGGCTGATTTTCCACCCAATCCGTCGCCTCATCTTCTACGAATTCCCTTGCTCGAAGCCTCATTTCTTAGAAGTAATCGTCCCCAAACTCAAACAATCCCTCTCACTAACCCTCAAACACTTCTTCCCACTCGCCGGCAACATCGTCTACCCTCTCAACTCCGGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796560.1
MTTALLETSQIAPPPEAAAEQSLPLTFMDIDWLIFHPIRRLIFYEFPCSKPHFLEVIVPKLKQSLSLTLKHFFPLAGNIVYPLNSGALPELRYIPGDSVPLSVCESSDDFDNFVANRARDADKFYGLIPQLPPMIVQSDSKLLRVLALQVTLFPDRGVCIGLANHHSAGDATSIAAFLRRWSSTSKIGGSDDEISISEAESLPIFDRSRFIYPAKLDPCSWNQIKEIPLPPPSLPLPTNRVRATYVLSKSELEKLKLSIQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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