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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000192`

染色体: Chr02 坐标: 2410924-2412487 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000192`
名称	SmilChr02G000192
描述	uncharacterized SmilChr02G000192
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2410924 - 2412487 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007828`
GeneID	`131007828`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007828`
原始查询	`SmilChr02G000192`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826611]; symbol=AT4G10200; hit=AT4G10200; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826611]; symbol=AT4G10200; hit=AT4G10200; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G10200` (AT4G10200) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826611] identity=43.5; qcov=0.949; evalue=6.62e-82; confidence=medium
Rice	`Os05g0311600` - identity=27.7; qcov=0.271; evalue=1.87e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007828

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790726.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790726.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790726.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790726.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790726.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2411384`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr2:2411384`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr2:2411407`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A23,B52,B87,B90,C61,C8
`Chr2:2411414`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B61,C75
`Chr2:2411442`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B90,C23,C28,C81,D11
`Chr2:2411442`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B90,C23,C28,C81,D11
`Chr2:2411444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C85
`Chr2:2411444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:2411451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C47,C48,C5
`Chr2:2411484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,C3,C39,C5
`Chr2:2411492`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	117	A10,A13,A2,A20,A23,A25,A3,A4,B10,B100,B104,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B123,B126,B127,B128,B13,B133,B134,B135,B139,B14,B140,B15,B19,B2,B20,B21,B23,B29,B30,B33,B34,B4,B41,B43,B49,B51,B52,B53,B56,B57,B63,B64,B66,B67,B71,B72,B73,B75,B77,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B9,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C12,C15,C17,C22,C23,C26,C27,C28,C29,C36,C37,C38,C39,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C54,C55,C56,C57,C6,C61,C62,C65,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C77,C78,C83,C85,C87,C9,D11,D4,D7,D9
`Chr2:2411515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790726.1

373 aa

186

373

DUF4371

PF14291 DUF4371 182-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790726.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	182	363	2.6e-27	96.6	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934743.1
GGGAAGGTATTAATCTCTTCAATTTCTCAATTTTTACCGTTGAATCAGAATCAGTCACATATATAGTTGTATAAATAGAATGAGGTAAATTAATTCTTCTCACCAATTTACTCTTTGATTATTGTCCTTCTTGTTCTTGAGCAAAAAAATTCACACTGTAATTTACAGATTGTCTTCGTTTGGGTTCGTAGCGGCGAAGATTGTTGTTGTACCCTCGTTGTCTATTTGTCTTCTGGAATCTGGATTGTAATTGACTATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007828
ATGGGGTTACCTAGAAAACAAGCATGTGGAAATGAGAAAAAGAAAAAAAGAAAAAGAATAGAAGAACTCACTAAATCACAGAAGGGTGATATGGATAAGTTTATTCTTAAGAATACAACTTCTAAAGAAAAAGCTGGAACTTCAAATGCGAACAATGTTGATGCGCTTCTTGAGATTGAAGATTCTAGTGAAAAGAGAAATGACTTGAATGAGAGTGAACATATTCTAAATATTTTAGATGATGAACCTAGAGAGAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790726.1
MGLPRKQACGNEKKKKRKRIEELTKSQKGDMDKFILKNTTSKEKAGTSNANNVDALLEIEDSSEKRNDLNESEHILNILDDEPRENDERFIPPVDIYDPRNWDNIDNNARDILVEKGPIREMNLVFPLDNISRHFSYTHYIRKLSNGEVKDRKWLVYSKHVDKVYCFCCKLFKNKQNTSCLATDGYRDWKHLSERLQEHENSVEHITNMNSWYELKMRLGKNETIDKDLQREISKEKDRWRQVLIRIIAAIKCLSKNCLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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