当前解析结果
SmilChr02G000197| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000197 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000197 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000197 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 2490229 - 2491768 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012604 |
|---|---|
| GeneID | 131012604 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012604 |
| 原始查询 | SmilChr02G000197 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012604 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796576.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057796576.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796576.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796576.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796576.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:2490268 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B22,B41 |
Chr2:2490311 |
CAA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A10,B131,C56 |
Chr2:2490311 |
CAA |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | A10,B131,C56 |
Chr2:2490316 |
A |
AGG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 3 | A10,B131,C56 |
Chr2:2490316 |
A |
AGG |
2bp_insertion | CDS_variant | 3 | A10,B131,C56 |
Chr2:2490348 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A10,B112 |
Chr2:2490348 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | A10,B112 |
Chr2:2490351 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A10,A2,A4,A5,A6,B112,B131,B139,B87,C45,C56 |
Chr2:2490355 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 14 | A10,A2,A21,A4,A5,A6,B112,B131,B139,B57,B87,C45,C54,C56 |
Chr2:2490362 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B139,C56 |
Chr2:2490370 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr2:2490377 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B39,C55 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。