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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000214`

染色体: Chr02 坐标: 2778166-2781351 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000214`
名称	SmilChr02G000214
描述	frataxin, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2778166 - 2781351 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012618`
GeneID	`131012618`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012618`
原始查询	`SmilChr02G000214`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	frataxin, mitochondrial
产物	frataxin%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G03240` (FH) frataxin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828013] identity=74.2; qcov=0.639; evalue=8.11e-62; confidence=high
Rice	`Os01g0783600` (OsISC22) - identity=59.9; qcov=0.732; evalue=1.78e-62; confidence=high
GO	GO:0004322 (ferroxidase activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006879 (intracellular iron ion homeostasis); GO:0008198 (ferrous iron binding); GO:0008199 (ferric iron binding); GO:0018283 (iron incorporation into metallo-sulfur cluster); GO:0034986 (iron chaperone activity); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01491 (Frataxin_Cyay)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012618

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796585.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796585.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796585.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796585.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796585.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2778358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:2778368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B68
`Chr2:2778421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:2778556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:2778562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:2779173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:2779382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B35
`Chr2:2780738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:2780753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,C17,C86,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796585.1

194 aa

194

Frataxin_Cyay

PF01491 Frataxin_Cyay 83-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796585.1`	Pfam	`PF01491`	Frataxin_Cyay	Domain	83	188	8.3e-40	135.9	Frataxin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940602.1
AGACAAATAAAATAGAAATTTTAATGAAGCTCGTAAAGAAGAAACGCTATTCGGCCCATATAAAAATATAGGCCCAAAAACAAGGGGAAAACCCAAAATAAGAATAGTAGTAACATATTTCAGCTTCGTTTCGTTTTTCCGGCCACCGAGAAATCGAGAAATTATGGCGATTCGATCGCTGAGAAGAGCGGTGTTGAGAGCTCTGAGCCCTCTTCAATCGTCGTCTTCTTTAATCCCAGCAACGCAAAACTCATCGCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012618
ATGGCGATTCGATCGCTGAGAAGAGCGGTGTTGAGAGCTCTGAGCCCTCTTCAATCGTCGTCTTCTTTAATCCCAGCAACGCAAAACTCATCGCTGTTTTCTCTCTCTAACTACTCAGCTGAACCCTCAACTTCTGCCAGTTATTCGTGCCCGAATTTCTCGTGCAATAGCATCCCCTGCCGCCGTCTCTCCTCTCTCACTGAGGAGGAATCTCACGGCCCCGCCGCGGTCAACTATTGCTCTTTGTTGACGGAAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796585.1
MAIRSLRRAVLRALSPLQSSSSLIPATQNSSLFSLSNYSAEPSTSASYSCPNFSCNSIPCRRLSSLTEEESHGPAAVNYCSLLTEEEYHKLANSTIHDLLEKLEEYGDSVDIDGFDVDYGNEVLTLKLGDFGTYVINKQTPNRQIWMSSPVSGPSRFDWDQKAEAWIYKRTKQNLFKVLETELEKLCNKPISLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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