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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000215`

染色体: Chr02 坐标: 2817805-2819017 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000215`
名称	SmilChr02G000215
描述	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	2817805 - 2819017 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012619`
GeneID	`131012619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012619`
原始查询	`SmilChr02G000215`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 2-like
产物	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 2-like
Arabidopsis	`AT5G54470` (BBX29) B-box type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835535] identity=57.9; qcov=0.444; evalue=6.18e-32; confidence=low
Rice	`Os08g0178800` (OsBBX24) - identity=66.7; qcov=0.322; evalue=8.25e-28; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00643 (zf-B_box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796586.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796586.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796586.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796586.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796586.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:2818195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,A8,B30,B7,C24
`Chr2:2818225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,D11
`Chr2:2818484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B21,C47,C49
`Chr2:2818521`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr2:2818521`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr2:2818590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:2818712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D4
`Chr2:2818737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796586.1

214 aa

107

214

zf-B_box

PF00643 zf-B_box 2-42 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796586.1`	Pfam	`PF00643`	zf-B_box	Domain	2	42	1.2e-06	29.3	B-box zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940603.1
CATGTTTGCCTTTAACCAATAAAGAACTGTTTCTACTTCCATACTTTCTTCTTCTTCTTCCTTCTCTCCTCTCTCTATTTCTCTCACATCAGTTACCACTTTCTCTCTCATCACTCCGCAACCGGAAAATTCTCTTCTCCTTTCCTCCCTTGGATATCTGGAATCGTATTCCTCCCTATCTCTTCATCTCCAGCGAAAATCAGTGATTTCTTCTCCAGAAATCGAGAGGAGCGATGAGGAGGTGTGAGTTGTGCAAAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012619
ATGAGGAGGTGTGAGTTGTGCAAAGCGAAGGCGCGGATGTACTGCGCGTCGGATCGGGCGAGCTTGTGCTGGGACTGCGACGCCGCCGTGCACTCCGCCAACTTCCTCGTGGCGCGGCATTCGAGGAACCTGCTCTGCGACGTCTGCCAGTCGCCGACGCCGTGGAGCGCCTCAGGCGGCAAGCTCGGCCCCACCGTCTCCGTCTGCGAGCAATGCGCCGGTCAGGAGATGTGCGAGGACAGCGGCGGCGGAGAATCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796586.1
MRRCELCKAKARMYCASDRASLCWDCDAAVHSANFLVARHSRNLLCDVCQSPTPWSASGGKLGPTVSVCEQCAGQEMCEDSGGGESESEEEELAEEEENQVVPWSPPPPAESYSSDDEAVDGQDVVVSRKLLRIEADRSCASSRLNIGAPPPYAAAVATSRSKTAPLHMTDSGRANACGSGILDSLRRLHREETGSGQEMAEFYDYSGPSDLNF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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